序列联配，又叫序列比对，是生物信息学的重要内容之一，许多生物信息学分析内容均涉及序列联配方法，如同源基因、功能域查找等。

    有两条序列联配和多条序列联配。

    根据序列联配的目的不同，可分为

    • 全局联配（Globial alignment）：目的是对两条序列的全长进行比对，目标是基于它们的全场序列获得最优匹配结果。
    • 局部联配（Local alignment）：目的是获得两条序列比对中得分最高的匹配片段。