参考
github: https://github.com/nextflow-io/nextflow
介绍:https://www.nextflow.io/docs/latest/getstarted.html
公众号 | 生信石头 | 初识Nextflow (系列之一)
知乎 | https://www.zhihu.com/column/c_1352338185490554880
介绍
下载
github: nextflow中已经有介绍如何安装
注意有时配置好java环境,对java的版本有要求,确保1.7版本以上。
java -version
#$ openjdk version "10.0.2" 2018-07-17
#$ OpenJDK Runtime Environment Zulu10.3+5 (build 10.0.2+13)
#$ OpenJDK 64-Bit Server VM Zulu10.3+5 (build 10.0.2+13, mixed mode)
- 如果已有多种版本,可以改变
JAVA_HOME
。
export JAVA_HOME=/home/shwzhao/bin/software/java/jdk-17.0.5/
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
- 也可以直接升级现有java,更新后重启终端
- 手动下载:https://www.oracle.com/java/technologies/downloads/