介绍

真核生物基因预测中目前最准确的一款软件,其他的貌似都不更新了。

基因模型文件:

  1. PASA 将 RNA-Seq 的转录本比对到基因组序列得到;
  2. GeneMark-ET 结合 RNA-Seq 数据进行基因预测后得到;
  3. 使用 MAKER 结合 RNA-Seq 得到的转录本序列进行基因预测得到;
  4. 使用 NCBI 的核酸数据库进行检索得到。

使用

运行

  1. https://genemark.bme.gatech.edu/

参考

  1. https://github.com/Gaius-Augustus/Augustus
  2. 官网:https://bioinf.uni-greifswald.de/augustus/