DNA 甲基化数据分析工具和数据库

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  • EpiScanpy：整合单细胞表观基因组分析

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      • 2021.05-PLoS Biol--整合转录组学和表观基因组学揭示人类和小鼠心脏的室特异性和物种特异性特征
      • 2019.09-NC--Tet失活破坏胚胎心脏发育期间的YY1结合和远程染色质相互作用
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      • DSS包多种组别比较的差异甲基化分析
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    • 中科院国家生物信息中心出品
      • scMethBank-Documentation
  • 公众号剪藏
    • ​BICCN专栏之一 | 总论：大脑皮层运动神经元图谱景观以及数据库联盟BICCN
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    • 肿瘤的表观遗传学（2万字深度总结）
    • 帕金森病与DNA甲基化研究
    • 白凡/钟茜组合作揭示EB病毒阳性胃癌肿瘤细胞与EB病毒共进化特征和潜在治疗靶点
    • 公司技术推广
      • 新时代的标志物开发利器---甲基化捕获技术应用
    • 方法学
      • 中科院计算所赵屹团队发表多组学数据融合深度学习框架——DeepOmix
      • CelFiE：新cfDNA分解方法，可基于甲基化状态准确估计cfDNA来源的细胞类型
      • 综述-单细胞DNA甲基化研究基础篇：从实验策略到数据分析方法简介
      • 全癌标志物来了，肿瘤筛查一网打尽还远吗？
      • 深读 | 给 DNA 甲基化检测装上 GPS，看肿瘤细胞如何变花样 - 知乎
      • ​Nat Commun｜李蔚/史偈君联合开发计算衡量DNA甲基化/去甲基化拮抗作用的方法
      • NAR | 激活沉默的抑癌基因，核内miRNA治疗前景光明
    • 研究表明阉割可延缓DNA老化，延长寿命
    • 850K DNA甲基化芯片检测必须知道的十问十答
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