ENCODE
Encyclopedia of DNA Elements,可以理解为“DNA元件百科全书”。
IHEC
International Human Epigenome Consortium,直译为“国际人类表观基因组联盟”。
DiseaseMeth
疾病相关甲基化分析数据库
SurvivalMeth
甲基化预后分析数据库
MethSurv
MethSurv : A web tool to perform multivariable survival analysis using DNA methylation data
开发人员:University of Tartu,注: 塔尔图(爱沙尼亚的第二大城市)
The Bioinformatics, Algorithmics, and Data Mining group (BIIT), Institute of Computer Science,
相关资料:MethSurv:TCGA甲基化分析工具
iMETHYL 基因组浏览器
数据库的目的:
通过iMETHYL基因组浏览器,我们的目标是在DNA甲基化上提供综合的多OMICS数据,以作为表观遗传研究等的基础或参考。 我们还对表观遗传调控的细胞类型特异性的重要性,每种细胞类型对DNA甲基化的不同模式具有不同的模式,并且可以通过细胞异质性模糊的表型之间的结果关系。
数据库的包含的数据来源:
using the two major immunological blood cell types, CD4T cells and monocytes, isolated from approximately 100 healthy subjects, we performed WGBS, WGS and RNA-Seq based on which we launched the iMETHYL genome browser. Then we added the methylome, genome and transcriptome data obtained from neutrophils to iMETHYL. Using the cell type-specific multi-omics data, we further conducted eQTL, eQTM and mQTL analyses and the results are also available on iMETHYL.
数据库的维护者为日本几个联合机构。
使用示例:
查看三个数据集在TP53基因附近的DNA甲基化信息,如下图
MEXPRESS
visualize DNA methylation, expression and clinical data
简介:https://mexpress.be/about
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MethyCancer
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