要点:
● 编码区域与增强子区域范围广泛覆盖的唯一组合
每份样本分析超过 850,000 个甲基化位点,可达单核苷酸分辨率
●**实验分析方法可重现性高 **
技术平行重复性>98%
● 简单的工作流程
PCR-free(无需聚合酶链式反应)的操作,结合强大的 Infinium HD Assay 实验分析方法
● 与福尔马林固定、石蜡包埋样本兼容
可提供适用于福尔马林固定、石蜡包埋样本的甲基化研究实验方案
简介
DNA 甲基化在调控基因表达中扮演了重要而动态的角色。细胞因此获得并维持特定状态,抑制病毒和非宿主 DNA 元件的表达,并促进对环境刺激的响应。异常的 DNA 甲基化(超或低甲基化)以及其对基因表达的影响已被证实与许多疾病相关联,包括癌症、神经疾病、衰老和发育等。
为了在更多应用领域提供更经济的 DNA 甲基化分析方案,Illumina 提供了一种可靠的甲基化谱分析平台,其中包含成熟的试剂以及 iScan 和 HiScan 系统。过去五年的甲基化组研究中,包括 ENCODE 和 FANTOM5 等计划,已发现增强子区域包含差异性甲基化的关键位点。
Infinium MethylationEPIC BeadChip 芯片(图 1)基于业界领先的 Infinium HumanMethylation450 BeadChip 芯片的基础上开发,包含原有 90% 以上的 CpG,外加新增的 350,000 个位于增强子区域的 CpG,又称为 850K 甲基化芯片。该实验分析方法能够在单个 CpG 位点的水平上提供定量甲基化测量,可适用于正常及福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样本,为深入了解表观遗传变化提供了强大的检测分辨率。
图 1:Infinium MethylationEPIC BeadChip 芯片
特有超过 850,000 个位于增强子区域、基因体、启动子和 CpG 岛上的 CpG。
全面的全基因组覆盖度
Infinium MethylationEPIC BeadChip 芯片非同一般地覆盖了 CpG 岛、RefSeq 基因、ENCODE 开放染色质、ENCODE 转录因子结合位点以及 FANTOM5 增强子区域(图 2)。Infinium HD 技术能够使内容选择摆脱因甲基化 DNA 捕获方法的偏向性而受到的相关限制。
更多信息请见公众号原文:一文了解 MethylationEPIC 850K 甲基化芯片