三维基因组学学习笔记

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Cut&Run和Cut&Tag数据分析

浏览 236 扫码 分享 2022-07-13 21:53:46

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    • 如何研究基因调控(专家点评)
    • HiChIP实验原理、技术背景和分析介绍
    • 一文读懂三维基因组(图文详解)
    • 三维基因组学入门
    • 三维基因组与疾病
    • 三维基因组学与精准生物学
    • 【三维基因组】浅谈三维基因组多组学联合-part1
    • 【三维基因组】浅谈三维基因组多组学联合-part3
    • 三维基因组学相关实验及分析简介
    • 3D基因组简介
    • 3D基因组—实验技术
    • 走向基因组3D世界 —染色体构想捕获技术3C(chromosome conformation capture)
    • 三维基因组中的开放染色质互作网络（一）
    • 三维基因组中的开放染色质互作网络（二）
    • 三维基因组中的开放染色质互作网络（三）
    • 三维基因组学及在疾病中的应用
    • 三维基因组简介--菲沙基因
      • 三维基因组技术（一）：简单介绍
      • 三维基因组技术（二）：Hi-C辅助组装与Lachesis的使用
      • 三维基因组技术（三）：Hi-C 数据比对及HiC-Pro的使用
      • 三维基因组技术（四）：Compartment 分析流程
      • 三维基因组技术（五）：TAD 分析流程
    • HiC数据分析
      • 3D基因组之HI-C数据分析
      • 3D基因组之Hi-C简介（二）
      • 3D基因组之Hi-C简介（一）
      • Hi-C 测序技术（图解详解）
      • 三维基因组可视化-washU browser
      • Jucer-arrowhead call TAD?
      • 高分辨率ABcompartment？尝试这两款！
      • HiC数据分析-TAD分析软件—DI
      • HiC数据分析-TAD分析软件—InsulationScore
      • Hi-C文库数据质控及解读
      • HiC数据分析-AB Compartment分析软件
      • Hi-C数据质控原理
      • 比较Hi-C数据分析的计算方法
    • ChIA-PET数据分析
      • 无标题
    • ATAC-seq数据分析
      • 评估测序文库复杂度 Library Complexity
      • 搞懂illumina nextera Tn5 和ATAC seq adaptor 序列
      • ATAC-Seq基础分析 高级分析 多组学分析
      • ATAC-Seq分析教程（十）：ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
      • ATAC-Seq分析教程（九）：差异peaks分析——DiffBind
      • ATAC-Seq分析教程（八）：用网页版工具做功能分析和motif分析
      • ATAC-Seq分析教程（七）：用ChIPseeker对peaks进行注释和可视化
      • ATAC-Seq分析教程（六）：重复样本的处理-IDR
      • ATAC-Seq分析教程（五）：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（二）ChIPQC
      • ATAC-Seq分析教程（四）：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（一）phantompeakqualtools
      • ATAC-Seq分析教程（三）：用MACS2软件call peaks
      • ATAC-Seq分析教程（二）：原始数据的质控、比对和过滤
      • ATAC-Seq分析教程（一）：ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同
      • 一文了解ATAC-seq
      • 一文读懂表观遗传学研究利器——ATAC-seq技术及应用丨深度长文
      • 一文读懂染色质可及性及ATAC-seq
    • ChIP-seq数据分析
      • ChIP技术
      • ChIP-Seq测序深度如何选择？
      • ChIP-Seq分析小实战（三）
      • ChIP-Seq分析小实战（二）
      • ChIP-Seq分析小实战（一）
      • 用ChIP-Seq公共数据探索组蛋白表观遗传修饰参与目标基因的调控情况
      • ChIP-seq基础入门
      • ChIP-seq的Input（对照）
      • MACS(Model-based Analysis of ChIP-Seq)使用说明
      • Chip-seq处理流程
      • ChIP-Seq分析常见问题集锦
      • ChIP-Seq概述及技术路线
      • ChIP-Seq综述
      • 一文读懂 ChIPseq
      • 图解表观遗传学 | 组蛋白修饰
      • 如何通过CHIP-seq分析鉴别基因启动子和增强子
    • Cut&Run和Cut&Tag数据分析
    • WGBS数据分析
      • 一文读懂DNA甲基化及BS-seq
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