功能如其名,“BLAST比对一些序列到一个大文件”。
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    整体界面功能如下:

    1. 设置待比对的序列,如某个或某几个序列
    2. 设置目标序列库,如某个物种基因组序列或转录本序列集合
    3. 设置输出文件路径,注意也可以点击“Temp”摁钮从而设置一个临时文件
    4. 比对参数信息:
    • Outfmt:设置输出文件格式,一般建议用BlastXML
    • Number of Threads:设置使用的最高线程数
    • E-value:设置比对结果最高期望值
    • Number of Hits:设置输出的 Hits 最高数目
    • Number of Alignments:设置输出的 Hsp 最高数目
    • Short Query Sequence (<=100bp):输入的查询序列是否较短,启动短输入敏感比对模式
    • Other Opts:其他可选参数

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    • Other Db Opts:即接受用户指定的建库特殊参数
    • Specify ‘Blast’?:用户指定使用 Blast 类型
    • Other Blast Opts:即接受用户指定比对特殊参数
    1. 点击 Start 即可开始比对
    2. Visualize:如果用户设置输出文件格式为 BlastXML,在比对完成后,可以点击该摁钮直接可视化比对结果
    3. Text View:调用 TBtools 的大文本浏览功能,查看比对结果(注意,目前支持搜索字符串与定位显示)