数据库相关

GO 富集分析 - go-basic.obo

请自行注意文件更新日期

  1. ## 高速通道
  2. https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
  3. ## 官方最新
  4. http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo

GO 注释相关

注意,一般现在推荐直接使用 eggNOG-mapper 注释,无需下载数据,详细见教程零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM…

  1. ## idmapping.tb.gz ~10Gb
  2. ## 高速通道
  3. https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045

KEGG 富集分析 - XXX.TBtoolsKeggBackEnd

使用 TBtools 进行 KEGG 富集分析,往往建议用户使用 TBtools 自行生成 BackEnd 文件,但是国内访问KEGG网站网速感人,故准备系列文件,放在此处,用户可自行按照需要下载

  1. ## 高速通道
  2. https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045

内容包括:

  1. Plants.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
  2. Animals.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  3. Archaea.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  4. Bacteria.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  5. Eukaryotes.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  6. Fungi.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  7. Prokaryotes.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
  8. Protists.20211129.TBtoolsKeggBackEnd

KEGG 注释相关

注意,一般现在推荐直接使用 eggNOG-mapper 注释,详细见教程零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM…

KEGG Pathway Mapp Illustrator - 通路着色数据库

KEGG 通路图稿上色并提供交互,一般建议用户使用 TBtools 自行准备好数据库文件,但是国内访问KEGG网站网速感人,故准备系列文件,放在此处,用户可自行按照需要下载

  1. ## TBtoolsKEGGMap.DB
  2. https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045

使用方式请参考
image.png

R插件相关

Rserver.plugin

所有 TBtools R 插件运行前均需要安装此插件

  1. https://tbtools.cowtransfer.com/s/68df33e849a84c

DESeq2 Win64 Meta Package

为 Windows 用户准备的 DESeq2 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

  1. # 2022年04月02日 - 更新
  2. https://tbtools.cowtransfer.com/s/672eefea30e14e

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

DESeq2 MacOS Meta Package

为 MacOS 用户准备的 DESeq2 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

  1. https://tbtools.cowtransfer.com/s/23e71f9ca08e47

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

CHeatmapShiny Win64 Meta Package

为 Windows 用户准备的 CHeatmapShiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

  1. https://tbtools.cowtransfer.com/s/2f8d3738f06c4e

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

CHeatmapShiny MacOS Meta Package

为 MacOS 用户准备的 CHeatmapShiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

  1. https://tbtools.cowtransfer.com/s/271a7df578d646

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
注意,如果安装后还运行失败,那么报错很可能是 ComplexHeatmap 依赖的 Cario包需要 X11 环境,通过链接 https://www.xquartz.org/ 下载安装即可

WGCNAshiny Win64 Meta Package

为 Windows 用户准备的 WGCNAshiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

  1. https://tbtools.cowtransfer.com/s/ed68de62d8c748

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

WGCNAshiny MacOS Meta Package

为 MacOS 用户准备的 WGCNAshiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

  1. https://tbtools.cowtransfer.com/s/06bef979c3c44a

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
注意,如果安装后还运行失败,那么报错很可能是 ComplexHeatmap 依赖的 Cario包需要 X11 环境,通过链接 https://www.xquartz.org/ 下载安装即可

众筹插件安装包

  1. https://tbtools.cowtransfer.com/s/6b6614f2dbe14b