数据库相关
GO 富集分析 - go-basic.obo
请自行注意文件更新日期
## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
## 官方最新
http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo
GO 注释相关
注意,一般现在推荐直接使用 eggNOG-mapper 注释,无需下载数据,详细见教程零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM…
## idmapping.tb.gz ~10Gb
## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
KEGG 富集分析 - XXX.TBtoolsKeggBackEnd
使用 TBtools 进行 KEGG 富集分析,往往建议用户使用 TBtools 自行生成 BackEnd 文件,但是国内访问KEGG网站网速感人,故准备系列文件,放在此处,用户可自行按照需要下载
## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
内容包括:
- Plants.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
- Animals.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
- Archaea.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
- Bacteria.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
- Eukaryotes.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
- Fungi.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
- Prokaryotes.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
- Protists.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
KEGG 注释相关
注意,一般现在推荐直接使用 eggNOG-mapper 注释,详细见教程零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM…
KEGG Pathway Mapp Illustrator - 通路着色数据库
KEGG 通路图稿上色并提供交互,一般建议用户使用 TBtools 自行准备好数据库文件,但是国内访问KEGG网站网速感人,故准备系列文件,放在此处,用户可自行按照需要下载
## TBtoolsKEGGMap.DB
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
R插件相关
Rserver.plugin
所有 TBtools R 插件运行前均需要安装此插件
https://tbtools.cowtransfer.com/s/68df33e849a84c
DESeq2 Win64 Meta Package
为 Windows 用户准备的 DESeq2 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
# 2022年04月02日 - 更新
https://tbtools.cowtransfer.com/s/672eefea30e14e
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
DESeq2 MacOS Meta Package
为 MacOS 用户准备的 DESeq2 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/23e71f9ca08e47
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
CHeatmapShiny Win64 Meta Package
为 Windows 用户准备的 CHeatmapShiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/2f8d3738f06c4e
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
CHeatmapShiny MacOS Meta Package
为 MacOS 用户准备的 CHeatmapShiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/271a7df578d646
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
注意,如果安装后还运行失败,那么报错很可能是 ComplexHeatmap 依赖的 Cario包需要 X11 环境,通过链接 https://www.xquartz.org/ 下载安装即可
WGCNAshiny Win64 Meta Package
为 Windows 用户准备的 WGCNAshiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/ed68de62d8c748
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
WGCNAshiny MacOS Meta Package
为 MacOS 用户准备的 WGCNAshiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/06bef979c3c44a
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
注意,如果安装后还运行失败,那么报错很可能是 ComplexHeatmap 依赖的 Cario包需要 X11 环境,通过链接 https://www.xquartz.org/ 下载安装即可
众筹插件安装包
https://tbtools.cowtransfer.com/s/6b6614f2dbe14b