很多时候,我们拿到一个 Fasta 序列文件,可能希望知道:
- 有多少个序列?
- 序列长度如何?序列总长度?
- 如果是DNA序列,GC含量如何?
- 每条序列信息指标,如长度,碱基组成等
- ….
Fasta Stat 功能可以快速完成上述统计信息。整体界面如下,
选项解释如下:
- 输入序列文件(File Input)也可以直接黏贴序列(Seq Input)
- 待输出的序列整体概况
- 可选设置,可不设置;如设置具体输出文件,则会将每条序列的统计信息输出到该文件
- 可选设置,若勾选,3. 中输出文件仅会包含序列ID及其长度(注意,这一功能主要是方便快速获取每条序列长度)
- 点击 Start 即可运行