TBtools Cookbook - TBtools 帮助手册教程

白天 夜间 首页 下载 阅读记录
  我的书签   添加书签   移除书签

TBtools 使用方法

浏览 1843 扫码 分享 2022-07-08 23:38:23
  • 启动 TBtools 软件
  • TBtools 主界面介绍
  • TBtools 功能使用详解

若有收获，就点个赞吧

0 人点赞

上一篇:
下一篇:
  • 书签
  • 添加书签 移除书签
  • 写在前面
    • 为什么写 TBtools
    • 为什么用 TBtools
    • TBtools 能干什么？- 用户 100 问！
    • TBtools 不能干什么？
    • 问题 | 如何有效提出 TBtools 使用问题从而快速获得回复并得到解决
  • TBtools 简介
    • TBtools 的功能概览
    • TBtools 的功能特性
    • TBtools 的用户社群
    • 正确引用 TBtools
  • TBtools 下载与安装
    • TBtools 的下载
    • TBtools 的安装
    • TBtools 的更新（软件/插件/配置）
    • Plugin | 插件下载与安装
    • 其他文件下载如大型插件/数据库链接
  • TBtools 使用方法
    • 启动 TBtools 软件
    • TBtools 主界面介绍
    • TBtools 功能使用详解
      • Sequence Toolskits
        • Fasta Tools
          • Fasta Extract (Recommended) - 序列提取/截取
          • Fasta Extract or Filter (Quick)
          • Fasta Extract (Basic)
          • Fasta Subseq (Basic)
          • Fasta Stat
          • Sequence Manipulate (Rev&Comp)
          • Fasta ID Simplify
          • Fasta Rename
          • Fasta ID Prefix
          • Fasta to Table Convert
          • Merge and Split
          • Fasta Get Representative
          • Sequence Pattern Locate
        • NCBI Sequence Fetch
          • GenBank to Fasta
          • NCBI Sequence Download (Basic)
          • Bulk NCBI Sequence Download (Advanced)
        • ORF Predicition
          • Complete ORF Predict (Single Mode)
          • Complete ORF Prediction (Batch)
          • Batch Translate CDS to Protein
        • GFF3/GTF Manipulate
          • GXF Sequence Extract
          • GXF Gene Position & Info Extract
          • GXF Re-build from Sequence
          • GXF mRNA Feature Re-calc
          • GXF ID Prefix
          • GXF Rename
          • GXF Representative mRNA ID Select
          • Representative GXF Obtain
          • GXF Region Overlap
          • GXF Select
          • GXF Fix
          • GXF Stat
      • BLAST
        • BLAST GUI Wrapper
          • Remote BLAST (via Web)
          • BLAST Zone
          • Several Sequences to a Big File [Commonly Used]
          • Two Sequence Sets
          • Two Sequence Files
        • BLASTXML Visualization
          • Imitate NCBI-Web Plot
          • Alignment View
          • BLAST XML Pileup Graph
        • BLASTXML to Table
        • eRace or eGenomeWalking
      • GO & KEGG
        • Gene Ontology
          • GO Annotation
          • GO Enrichment
          • GO Level Count
        • KEGG
          • KEGG Pathway Map Illustrate
          • KEGG Enrichment Analysis
        • Common Tools
          • Enrichment Bar Plot
          • eggNOG-mapper Helper
          • Simple Enrich
  • FAQ 常见问题与解决方案
    • BLAST
      • Unknow argument: "blast_version"
    • 进化分析
    • 通用常规问题
      • TBtools [突然] 无法打开?
      • TBtools | 开箱须知
      • 软件 安装/更新/打开/关闭/卸载 相关
    • 插件相关问题
      • 请问我在使用WGCNA shiny插件时，输入教程里的demo文件时，出现图形API版本不相符的错误，请问这该怎么操作呀？
      • 提示 Please install Rserver plugin?
      • DESeq2 插件分析结果没报错，输出文件为空？
      • OneStepWGCNA 点击运行后报错~
    • GO/KEGG或通用富集分析
      • 为什么 pvalue都是 1？
      • 如果转成成 TBtools GO富集分析需要的背景文件格式？
      • TBtools 不支持 Excel.xlsx 等二进制文件
    • GFF3/GTF相关
      • 基因密度分析导出文件是0kb？
      • 提取 CDS 或者 启动子 序列（GFF3/GTF）输出空白文件
      • GXF Fix/Stat 报错？如何解决
    • 共线性分析
      • Dual Synteny Plot 很多黑块，很乱？
      • One Step MCscanX 报错，“Chr ID is not consistent.....”
    • 可视化（图片绘制、保存、修改等）
      • 启动子元件可视化没反应~输入文件没问题？
      • 如何保存图片？火山图，Circos图等绘制
      • SeqLogo / Motifs 的“I”都成一方块了？
      • TBtools中在植物模型里绘制热图，是用哪个热图绘制？
      • 基因结构可视化报错？Invalid line乱码
      • 基因结构可视化报错？A Big Warning!
    • 超越 TBtools
      • 提交序列到NCBI BLAST，显示比对序列过长应该怎么办呢？
  • TBtools 实用教程
    • 实用！便携且高效 去除 基因组序列和注释 碎片
    • 动态交互！感兴趣的基因标记在 KEGG Pathway 通路图上
    • 可视化！Circos 图绘制，更简单更灵活更方便~
    • Plugin | 高速版插件商店！我又有一个绝妙的 idea
    • 点点点，KEGG Pathway 通路富集分析
    • 用户来稿 | GFF3/GTF 批量重命名的前世今生
    • 「GO富集分析」从原理到实践 ~ 零基础掌握
    • 简捷 | BLAST Zone 从数据库中直接提取序列！
    • 零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM...
    • 使用 TBtools 生成最新 KEGG BackEnd 文件
    • 解决方案！TBtools R Plugin 安装~ 终极奥义
    • TBtools | 地球最友好的 GFF3/GTF 序列提取工具
    • 大范围查找序列模式所在位置，用TBtools啊~
    • 以热图为例，展示图形可交互的有趣之处
    • 教程 | “美好体验”本地 BLAST 基因功能鉴定
    • 我写了一个简单的进化树可视化/注释工具
    • !Help | 我又有一个有趣的想法！
    • 插件 | 蛋白序列集合功能注释快速完成 - Quick Protein Anno
    • TBtools | 多图合一至强版教程！进化树 Motifs 结构域 启动子 基因结构 ....
    • windows下直接跑MEME suite？对！任何人都可以。
    • 贴心 | GXF Fix 修复 / 优化基因结构注释信息文件 - GTF/GFF3
    • 稀有 | GXF Stat 一次统计物种的Gene/mRNA/Exon/Intron/CDS/UTR...信息
    • Fasta序列文件合并与分割，支持.seq等无头序列
    • 手动更新 | 一个无关紧要但又很方便的功能更新
  • 开发感悟
    • 为什么找不到「TBtools」收费课程 ？
    • 通告 | TBtools 的学术使用与商业授权
    • 我的挣扎 与 TBtools 的开发
暂无相关搜索结果！

    让时间为你证明

    展开/收起文章目录

    分享，让知识传承更久远

    文章二维码

    手机扫一扫，轻松掌上读

    文档下载

    请下载您需要的格式的文档，随时随地，享受汲取知识的乐趣！
    PDF文档 EPUB文档 MOBI文档

    书签列表

      阅读记录

      阅读进度: 0.00% ( 0/0 ) 重置阅读进度
        思维导图备注