| 缩写 | 中文译名 | 支链 | 分子量 | 等电点 | 羧基解离常数 | 氨基解离常数 | Pkr(R) | R基 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| G | 甘氨酸 | 亲水性 | 75.07 | 6.06 | 2.35 | 9.78 | -H | ||
| A | 丙氨酸 | 疏水性 | 89.09 | 6.11 | 2.35 | 9.87 | -CH₃ | ||
| V | 缬氨酸 | 疏水性 | 117.15 | 6.00 | 2.39 | 9.74 | -CH-(CH₃)₂ | ||
| L | 亮氨酸 | 疏水性 | 131.17 | 6.01 | 2.33 | 9.74 | -CH₂-CH(CH₃)₂ | ||
| I | 异亮氨酸 | 疏水性 | 131.17 | 6.05 | 2.32 | 9.76 | -CH(CH₃)-CH₂-CH₃ | ||
| F | 苯丙氨酸 | 疏水性 | 165.19 | 5.49 | 2.20 | 9.31 | -CH₂-C₆H₅ | ||
| W | 色氨酸 | 疏水性 | 204.23 | 5.89 | 2.46 | 9.41 | -C₈NH₆ | ||
| Y | 酪氨酸 | 疏水性 | 181.19 | 5.64 | 2.20 | 9.21 | 10.46 | -CH₂-C₆H₄-OH | |
| D | 天冬氨酸 | 酸性 | 133.10 | 2.85 | 1.99 | 9.90 | 3.90 | -CH₂-COOH | |
| N | 天冬酰胺 | 亲水性 | 132.12 | 5.41 | 2.14 | 8.72 | -CH₂-CONH₂ | ||
| E | 谷氨酸 | 酸性 | 147.13 | 3.15 | 2.10 | 9.47 | 4.07 | -(CH₂)₂-COOH | |
| K | 赖氨酸 | 碱性 | 146.19 | 9.60 | 2.16 | 9.06 | 10.54 | -(CH₂)₄-NH₂ | |
| Q | 谷氨酰胺 | 亲水性 | 146.15 | 5.65 | 2.17 | 9.13 | -(CH₂)₂-CONH₂ | ||
| M | 甲硫氨酸 | 疏水性 | 149.21 | 5.74 | 2.13 | 9.28 | -(CH₂)-S-CH₃ | ||
| S | 丝氨酸 | 亲水性 | 105.09 | 5.68 | 2.19 | 9.21 | -CH₂-OH | ||
| T | 苏氨酸 | 亲水性 | 119.12 | 5.60 | 2.09 | 9.10 | -CH(CH₃)-OH | ||
| C | 半胱氨酸 | 亲水性 | 121.16 | 5.05 | 1.92 | 10.70 | 8.37 | -CH₂-SH | |
| P | 脯氨酸 | 疏水性 | 115.13 | 6.30 | 1.95 | 10.64 | -C₃H₆ | ||
| H | 组氨酸 | 碱性 | 155.16 | 7.60 | 1.80 | 9.33 | 6.04 | ||
| R | 精氨酸 | 碱性 | 174.20 | 10.76 | 1.82 | 8.99 | 12.48 |
实验环境
mac 10.14 64-bit
python=3.7.2
Keras=2.2.4
Keras-Applications=1.0.7
Keras-Preprocessing=1.0.9
graphviz=0.10.1
numpy=1.16.2
pandas=0.24.1
pydot=1.4.1
pydot-ng=2.0.0
scikit-learn=0.20.3
scipy=1.2.1
PyYAML=5.1
six=1.12.0
tensorboard=1.13.1
tensorflow=1.13.1
tensorflow-estimator=1.13.0
1 Dense 神经网络 https://blog.csdn.net/malele4th/article/details/79429028
2 optimizer 优化器 https://blog.csdn.net/weixin_41417982/article/details/81561210
3 Binarycrossentropy损失函数 https://blog.csdn.net/legalhighhigh/article/details/81409551
4 Dropout随机失活 https://blog.csdn.net/program_developer/article/details/80737724
a22=w1-22x1+w2-22x2+…+w43-22+b1-22
（m∈{‘A’, ‘L’, ‘R’, ‘K’, ‘N’, ‘M’, ‘D’, ‘F’, ‘C’, ‘P’, ‘Q’, ‘S’, ‘E’, ‘T’, ‘G’, ‘W’, ‘H’, ‘Y’, ‘I’, ‘V’, ‘O’}）
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