作者:Zuguang Gu8
编译:Steven Shen
原文:About
这是 ComplexHeatmap 包的文档。本书中的示例是在 2.1.0 版本下生成的。本书籍 Github 地址:https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmap-reference。
您可以从 http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/ComplexHeatmap.html 获得稳定的 Bioconductor 版本,但最新版本始终在 Github 上,您可以通过以下方式安装它:
library(devtools)
install_github("jokergoo/ComplexHeatmap")
Bioconductor 上的开发分支基本上与 Github 存储库同步。
The ComplexHeatmap package is inspired from the pheatmap package. You can find many arguments in ComplexHeatmap have the same names as in pheatmap. Also you can find this old package that I tried to develop by modifying pheatmap.
ComplexHeatmap 包的灵感来自 pheatmap 包。 您可以在 ComplexHeatmap 中找到许多与 pheatmap 中的名称相同的参数。你也可以找到我试图通过修改 pheatmap 开发的这个旧包。
Please note, this documentation is not completely compatible with older versions (< 1.99.0, before Oct, 2018), but the major functionality keeps the same.
请注意,此文档与旧版本(<1.99.0,2018年10月之前)不完全兼容,但主要功能保持不变。
如果您在出版物中使用了 ComplexHeatmap,您可以使用以下的引用,我将不胜感激:
Gu, Z. (2016) Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data. DOI: 10.1093/bioinformatics/btw313
—— 本章完 ——