操作系统为 Red Hat Enterprise 6.5 x86_64。

    注意:

    1. $ export LDFLAGS="-L/Bioinfo/APPS/boost_1.55/lib"
    2. $ export CPPFLAGS="-I/Bioinfo/APPS/boost_1.55/include"
    3. $ export C_INCLUDE_PATH="/Bioinfo/APPS/boost_1.55/include"
    4. # export BOOST_ROOT="/Bioinfo/APPS/boost_1.55/include/boost"
    5. # 如果设置了 BOOST_ROOT,会导致 error: cannot find Boost headers version >= 1.48.0 异常
    6. $ unset BOOST_ROOT,会导致

    执行安装:

    1. $ wget http://www.cs.ubc.ca/labs/beta/Projects/codon-optimizer/downloads/codon-optimizer-0.1.tar.gz
    2. $ tar zvxf codon-optimizer-0.1.tar.gz
    3. $ cd codon-optimizer-0.1
    4. $ ./configure --prefix=/Bioinfo/Pipeline/SoftWare/codon-optimizer-0.1
    5. $ make
    6. $make install

    简单总结:

    1. codon-optimizer-0.1 的安装需要 boost,CentOS 6 自带的 bootst-1.41.0-18.el6.x86_64。
    2. CentOS 6 貌似没有 1.41.0 以上的 boost rpm 包,只有 boost148-xxx.rpm、boost169-xxx.rpm 之类。
    3. 源码安装 boost 请参考:CentOS 安装 boost 库