R

笔者不用 R，这是历史积累的材料，疏于整理，见谅。

学习材料

教材

• R语言实战
• R Cookbook
• R in action
• Advanced R
• ggplot2 elegant graphics
• Crawley Statistics an introduction using R
• Peter Dalgaard Introductory statistics with R
• E. Paradis R for Beginners
• Verzani SimpleR.
• D G Rossiter Introduction to the R Project for Statistical Computing for use at ITC
• J. Maindonald Using R for data analysis and graphics introduction code and commentary using R
• Venables, W. N. & Ripley, B. D.

• Modern Applied Statistics with S

  在线材料

• R主页: http://www.r-project.org

• R资源列表 NCEAS http://www.nceas.ucsb.edu/scicomp/software/r
• R Graphical Manual http://bm2.genes.nig.ac.jp/RGM2/index.php
• 统计之都: http://cos.name/
• QuikR http://www.statmethods.net/
• 丁国徽的R文档: http://www.biosino.org/R/R-doc/
• R语言中文论坛 http://rbbs.biosino.org/Rbbs/forums/list.page
• https://www.r-bloggers.com/
• https://google.github.io/styleguide/Rguide.xml Google’s R Style Guide
• http://www.rdatamining.com/
• tidy data
• http://vita.had.co.nz/papers/tidy-data.pdf
• https://www.statmethods.net/
• http://adv-r.had.co.nz/
• http://www.htmlwidgets.org/ Bring the best of JavaScript data visualization to R
• http://www.r-graph-gallery.com/all-graphs/
• R语言中文社区 公众号

packages

聚类

常用的包： fpc，cluster，pvclust，mclust
基于划分的方法： kmeans， pam， pamk， clara
基于层次的方法： hclust， pvclust， agnes， diana
基于模型的方法： mclust
基于密度的方法： dbscan
基于画图的方法： plotcluster， plot.hclust
基于验证的方法： cluster.stats

分类

常用的包：rpart，party，randomForest，rpartOrdinal，tree，marginTree，
maptree，survival
决策树： rpart， ctree
随机森林： cforest， randomForest
回归， Logistic回归， Poisson回归： glm， predict， residuals
生存分析： survfit， survdiff， coxph

关联规则与频繁项集

常用的包：
arules：支持挖掘频繁项集，最大频繁项集，频繁闭项目集和关联规则
DRM：回归和分类数据的重复关联模型
APRIORI算法，广度RST算法：apriori， drm
ECLAT算法： 采用等价类，RST深度搜索和集合的交集： eclat

时间序列

常用的包： timsac
时间序列构建函数： ts
成分分解： decomp， decompose， stl， tsr

统计

常用的包： Base R， nlme
方差分析： aov， anova
密度分析： density
假设检验： t.test， prop.test， anova， aov
线性混合模型：lme
主成分分析和因子分析：princomp

图表

条形图： barplot
饼图： pie
散点图： dotchart
直方图： hist
树： rpart
密度图： densityplot
蜡烛图， 箱形图 boxplot
热图， contour： contour， filled.contour
QQ (quantile-quantile) 图： qqnorm， qqplot， qqline
Parallel coordinates： parallel， paracoor， parcoord
其他图： stripplot， sunflowerplot， interaction.plot， matplot， fourfoldplot，
assocplot， mosaicplot

数据处理

缺失值：na.omit
变量标准化：scale
变量转置：t
抽样：sample
堆栈：stack， unstack
其他：aggregate， merge， reshape

其他

• rattle包
• R语言有没有一种类似于SAS之EM或SPSS之Modeler的界面化操作。通过该包就可以实现界面化操作的数据分析、数据挖掘流程。
• 用tidyr包为整理你的数据
• 用stringr进行字符串操作
• 工作时的时间和日期的安装lubridate封装使其工作与这些更容易一点。
• 像zoo,xtsandquantmod这类包可以帮助你在中R进行时间序列分析
• 交互式Web图形ggvis
• 谷歌的图表界面googleVis
• plotly R（在线数据分析制图工具- 小众软件）
• ggthemr助你制作惊艳美图
• chinese.misc 中文文本分析方便工具包
• Rprof R语言性能监控工具
• ggtech：ggplot2的扩展配色包