作业链接:https://mp.weixin.qq.com/s/GA-VHrSnKli4ivDcOSXMLw 文章题目:Cathepsin C promotes breast cancer lung metastasis by modulating neutrophil infiltration and neutrophil extracellular trap formation. Cancer Cell. 2021 Mar 原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33450198/

作业解析

研究者对荷兰癌症研究所(NKI)发表的乳腺癌基因表达数据进行分析,绘制出来了如下所示的单样本的gsea分析图表,复现此图。
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数据分析大纲

下载表达量矩阵

读文献拿到3个基因集的基因列表

针对基因列表去表达量矩阵里面走ssGSE分析

对ssGSE分析值与CTSC表达量进行相关性计算

绘制热图