【CGM在线沙龙预告】水稻株型驯化极简史：1 3=1

CGM将于2019年6月12日星期三举办第55期在线沙龙活动。我们邀请到了李显然博士来做一期题为“水稻株型驯化极简史：1+3=1”的学术报告。YouTube直播开始时间是太平洋时间 (Pacific Time)下午6点。请点击文末阅读原文，前往CGM网站观看直播。国内的朋友也请留意CGM官网，腾讯录播视频会在直播结束以后上线哦！

嘉宾简介：

李显然博士本科毕业于北京理工大学，2008年在中国农业大学获得作物遗传育种专业博士学位。曾先后在华大基因（BGI）和堪萨斯州立大学（Kansas State University）工作。目前在爱荷华州立大学（Iowa State University）于建明教授实验室担任Scientist.
研究方向包括 (摘自https://www.agron.iastate.edu/people/xianran-li) ：
1) understand and utilize crop performance plasticity;
2) identify and understand functional polymorphisms underlying agronomic important traits;
3) explore and understand evolutionary patterns about base composition dynamics along evolution.

摘要概述：

关键词：
Parallel domestication, rice plant architecture, tandem repeats

通过改变生长习性，塑造有利株型，进而提高产量，是作物驯化过程中至关重要的一步。利用完全匍匐生长的元江普通野生稻 (Oryza rufipogon) ，我们前期的工作表明PROG1基因的隐性变异是选择直立生长的一个重要靶点。

最近，利用携带隐性prog1但半匍匐生长的东乡普通野生稻, 我们发现prog1下游1.2-kb的约110-kb的染色体缺失导致了半匍匐到直立生长习性的转变。该缺失片段包含7个与PROG1基因相似的锌指基因，形成了一个锌指基因串联重复结构。在亚洲水稻 (O. sativa)驯化过程中，该染色体片段的缺失导致功能锌指基因的丢失，推动了株型的转变，最终实现产量的大幅度提高。基于这一新的发现，我们把该位点重新命名为RPAD (RICE PLANT ARCHITECTURE DOMESTICATION)位点。

同时，在大约三千年前起源于非洲一年生野生稻 (O. barthii)的非洲栽培稻 (O.glaberrima)的RPAD位点，也存在一个与亚洲栽培稻相似的但独立发生的约113-kb染色体片段缺失导致了非洲栽培稻的直立生长。解析RAPD位点说明该位点的染色体片段缺失驱动了亚洲栽培稻和非洲栽培稻株型的平行驯化。RPAD位点染色体结构变异的多样性表明的串联重复序列可能促进了不等交换, 从而诱导了高频的有利自发突变供古人重复选择优良性状。我们的研究提供平行驯化发生的可能分子机制。

视频：

CGM 第 55 期：水稻株型驯化极简史：1+3=1

参考文献：

1. Yongzhen Wu, Shuangshuang Zhao, Xianran Li, Bosen Zhang, Liyun Jiang, Yanyan Tang, Jie Zhao, Xin Ma, Hongwei Cai, Chuanqing Sun and Lubin Tan. Deletions linked to PROG1 _gene participate in plant architecture domestication in Asian and African rice. **_Nature Communications, **2018, 9:4157.
   
2. Lubin Tan, Xianran Li, Fengxia Liu, Xianyou Sun, Chenggang Li, Zuofen Zhu, Yongcai Fu, Hongwei Cai, Xiangkun Wang, Daoxin Xie and Chuanqing Sun. Control of a key transition fromprostrate to erect growth in rice domestication. Nature Genetics, 2008,40: 1360-64.
   

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