【CGM在线沙龙预告】追踪水稻里活跃的转座子家族 - 图1
CGM将于2019年4月3日星期三举办第50期在线沙龙活动。我们邀请了陈金锋博士来做一期题为 “**Tracking the burst of an active transposon family in rice**” 的学术报告。YouTube直播开始时间是太平洋时间(Pacific Time)下午6点。请点击文末阅读原文,前往CGM网站观看直播。国内的朋友也请留意CGM官网,录播视频会在直播结束以后上线哦!

嘉宾简介:

【CGM在线沙龙预告】追踪水稻里活跃的转座子家族 - 图2
陈金锋博士目前所在单位是加州大学河滨分校。他本科及硕士就读于西北农林科技大学(2000-2006),博士就读于中国科学院遗传与发育生物学研究所(2006-2012),从2013年至今在加州大学河滨分校从事博士后研究,现在是助理项目科学家。陈金锋博士的工作重点为水稻基因组,QTL,以及基因组组装等。

摘要概述(嘉宾提供):

转座子,也叫跳跃基因,是真核基因组的主要组成成分,也是基因组中变化最活跃的部分。基因组中绝大部分转座子被认为是没有功能的,也就是“垃圾 DNA”,但是当转座子插入到基因附近时,往往会造成基因突变或者参与基因调控。尤其是在转座子含量比较丰富的作物基因组中,绝大部分基因附近都有转座子的插入,所以转座子在作物基因组进化中有着重要的作用。
尽管我们对于转座子的功能有所了解,但是对于转座子如何在宿主基因组中进行大量扩增这个问题仍然很困惑,这其中一个很重要的原因是绝大部分的转座子家族是没有活性的,也就是不能跳跃。宿主基因组具有完整的免疫系统可以识别并抑制转座子的活性,那么转座子如何突破或者逃逸宿主的抑制从而实现扩增?这个问题需要在一个转座子活跃跳动的系统中进行研究。
在本次报告中,我将以水稻中一类活跃的转座子为例,探讨转座子如何逃逸宿主抑制,如何在进化过程中实现大规模扩增。

参考文献:

Chen, J., Lu, L., Benjamin, J., Diaz, S., Hancock, C.N., Stajich, J.E., Wessler, S.R. (2019) Tracking the origin of two genetic components associated with transposable element bursts in domesticated rice. Nat Commun 10:641.
Lu, L., Chen, J., Robb, S., Okumoto, Y., Stajich, J., and Wessler, S. (2017) Tracking the genome-wide outcomes of a transposable element burst over decades of amplification. _Proc Natl Acad Sci USA _114:E10550–E10559.
封面图源:http://sitn.hms.harvard.edu/flash/2018/transposons-your-dna-thats-on-the-go/

关注我们:

【CGM在线沙龙预告】追踪水稻里活跃的转座子家族 - 图3
CGM网站: cgmonline.co
YOUTUBE频道: Chinese Genomics Meet-up
微信群: 请添加微信好友beckyhao13,并注明”CGM”