CGM 第 87期:基因组数据分析揭示的番薯进化简史 - 图1**CGM将于北京时间2020年325周三晚上9点举办第87期在线沙龙活动。我们邀请到了上海辰山植物园杨俊博士来做一期题为“基因组数据分析揭示的番薯进化简史” 的学术报告。Bilibili(关注: CGMonline)直播于北京时间周三晚上9点开始。zoom会议ID:710 916 921。
    嘉宾简介**:
    杨俊,男,博士,洪堡学者,副研究员。2011年中国科学院博士毕业;2012年荣获ProSPER.Net-Scopus青年科学家奖;2013年接受德国洪堡基金会(Alexander von Humboldt Stiftung)邀请前往柏林马普分子遗传所从事独立研究,主攻多倍体基因组组装难题;2014年科技部国际合作专项获得批准;2016年初正式加入上海辰山植物园开始组建旋花科进化研究组;2017年最终完成六倍体甘薯基因组测序;2018年科技部国际合作专项顺利结题,同年承担科技部重点研发项目子课题;2019组织召开第一届国际旋花科会议,致力于旋花科植物进化关系研究;目前是中国科学院青年创新促进会成员。

    杨俊长期从事甘薯遗传转化、基因组研究分析工作,聚焦于解析甘薯块根膨大机制、六倍体甘薯基因组组成和起源等,主要研究成果发表在Nature PlantsMolecular PlantNature CommunicationsPlant Science等国际著名学术期刊上,并应Frontiers in Plant Science杂志邀请作为客座副主编组织Genetics and Genomics of Polyploid Plants研究专题。

    近年来研究突破主要包括:
    (1) 完成六倍体甘薯基因组测序回溯甘薯物种起源历史
    http://m.thepaper.cn/newsDetail_forward_1773959
    (2) 建立旋花科基因组研究全球协作网络和番薯属基因组数据库
    https://ipomoea-genome.org/
    (3) 建立和优化了高效的甘薯遗传转化体系用于研究块根形成机理
    image.png

    中文摘要:

    一百三十万年前,南美的一棵野草开始遐想;
    八十万年前,她的后代DNA翻了个倍(WGD);
    五十万年前,保守派和激进派居然相爱并诞生结晶;
    一万年前,可怜的人类终于找到富余的食物,从此踏上毁灭地球的征途。
    以上是我总结的番薯的故事,其实她的演化和我们人类没多大关系,只在近来取而用之。
    一切事实已然存在,我只是在试图把历史看得更清而已?

    多倍体作物起源研究借助超摩尔定律发展的测序分析技术迎来新的曙光。
    挑战和机遇并存,惟愿借此机会抛砖引玉,激发兴趣。
    已有兴趣的,可以读一下我们的文章
    准备挑战的,选一个自己喜欢的物种
    Zoom:
    北京时间: 2020 年 3 月 25 日(星期三)9 PM
    美西时间: 2020 年 3 月 25 日 6 AM (PST)
    https://zoom.com.cn/j/710916921
    Meeting ID: 710 916 921
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