CGM将于2019年7月24日星期三举办第58期在线沙龙活动。我们邀请到了陈秋月博士来做一期题为“玉米可变剪接变异研究”的学术报告。YouTube直播开始时间是太平洋时间 (Pacific Time)下午6点，北京时间周四上午9点。请点击文末阅读原文，前往CGM网站观看直播。国内的朋友也请留意CGM官网，腾讯录播视频会在直播结束以后上线哦！
嘉宾简介：
陈秋月博士本科毕业于西南大学农学专业，博士就读于中国农业大学，在田丰教授实验室主要进行QTL,eQTL, and sQTL mapping等研方面的研究，2017年取得作物遗传育种专业博士学位。毕业后在威斯康辛大学麦迪逊分校 (University of Wisconsin-Madison) Doebley lab (https://teosinte.wisc.edu/)担任research associate，研究方向是玉米的驯化。
摘要概述：
关键词：
Maize, Alternative Splicing, GWAS
玉米是重要的粮食作物、饲料作物和能源作物。近年来，随着高通量测序技术和计算生物学的发展，玉米功能基因组的研究已不再局限于传统的基因克隆。基因组、表观组、转录组、蛋白组、代谢组等各种组学手段使得基因功能的研究达到空前的规模和分辨率，大大促进了研究者对复杂数量性状形成机制的解析。
根据遗传学的中心法则，转录调控是最基本的一个环节。基因表达变异是表型变异的重要来源。在群体水平定位基因表达数量性状位点（expression quantitative trait locus, eQTL）早已成为研究基因表达变异的重要手段。除了转录调控之外，转录后调控也是基因表达调控的重要环节，其中可变剪接是最为重要的一种转录后修饰方式，可变剪接变异也是表型变异的重要来源。
但是，目前在群体水平定位可变剪接数量性状位点（splicing quantitative trait locus, sQTL）的研究在植物中还很少有报道。本研究以368份玉米自交系授粉后15天未成熟籽粒为材料，在转录组数据的基础上，结合125万个高密度SNP分子标记，对未成熟籽粒的可变剪接变异进行全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS），解析了可变剪接自然变异的遗传结构，探讨了可变剪接调控的分子机制、可变剪接与基因表达调控之间的关系，以及可变剪接对表型变异的贡献。
参考文献：
参考文献：
Qiuyue Chen#,Yingjia Han, Haijun Liu, Xufeng Wang, Jiamin Sun, Binghao Zhao, Weiya Li, Jinge Tian, Yameng Liang, Jianbing Yan, Xiaohong Yang, and Feng Tian. Genome-wide association analyses reveal the importance of alternatives plicing in diversifying gene function and regulating phenotypic variation in maize. The Plant Cell, 2018, 30(7):1404-1423.
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