CGM在线沙龙预告】追踪植物基因组复制事件

CGM将于2019年7月10日星期三举办第57期在线沙龙活动。我们邀请到了赵美霞博士来做一期题为“植物重复基因进化的基因组学和表观基因组学研究”的学术报告。YouTube直播开始时间是太平洋时间 (Pacific Time)下午6点。请点击文末阅读原文，前往CGM网站观看直播。国内的朋友也请留意CGM官网，腾讯录播视频会在直播结束以后上线哦！

嘉宾简介：

赵美霞博士2007年本科毕业于合肥工业大学，2013年在中国农业科学院获得生物化学与分子生物学博士学位，博士期间曾在普渡大学（Purdue University）完成植物遗传学与基因组学的联合培养。2013-2018年在普渡大学接受植物遗传学与表观遗传学的博士后科研训练。目前在迈阿密大学（Miami University）担任助理教授，研究方向是（表观）基因组学及生物信息学，以下摘自https://miamioh.edu/cas/academics/departments/biology/about/faculty/zhao/index.html
Ongoing research area includes
1) Comparative genomics and epigenomics in plant evolution;
2) Genetic dissection of important agronomic traits in maize;
3) Epigenetic regulation in soybean and maize.

摘要概述：

关键词：
Polyploidy, Fractionation, MIRNA Genes, Co-evolution, Recombination

多倍化或全基因组复制是植物基因组的一个重要特征，但目前对于这些重复基因的进化机制并不是很清楚。我们以玉米和大豆两个重要农作物的基因组作为研究对象，发现虽然这两个物种最近的一次全基因组复制发生的时间点相差不大，但玉米的两个亚基因组在基因表达量、转座子含量、小RNA、DNA甲基化和基因丢失数目上差异很大。大豆的两个亚基因组之间没有观察到显著差别。尽管如此，大豆的个体重复基因却在这些特征上呈现出很大的差异。

为进一步研究重复基因的功能分化，我们对大豆油脂合成中的重复基因的功能进行了研究，阐述了油脂合成相关重复基因的亚功能化、新功能化以及假功能化。在重复蛋白编码基因的研究基础上，我们还探讨了重复MIRNA基因的进化机制，并且发现MIRNA基因和它的靶基因呈现出共同进化的现象。

目前，我的实验室一个重要的研究项目是探讨表观遗传学，比如DNA甲基化和组蛋白修饰，以及活跃和沉默的转座子影响玉米和大豆减数分裂重组率的方式。

视频：

CGM 第 57 期：基因组学和表观基因组研究植物重复基因进化

参考文献：

1. Zhao M., Zhang B., Lisch D., and Ma J. 2017. Patterns and consequences of subgenome differentiation provide insights into the nature of paleopolyploidy in plants. _Plant Cell _29:2974-2994.
   
2. Zhang D., Zhao M., Li S., Sun L., Wang W., Cai C., Dierking E., and Ma J. 2017.Plasticity and innovation of regulatory mechanisms underlying seed oil content mediated by duplicated genes in the palaeopolyploid soybean. Plant J. 90: 1120-1133. (Equal contributors)
   
3. Zhao M., Meyers B.C., Cai C., Xu W., and Ma J. 2015. Evolutionary patterns and co-evolutionary consequences of MIRNA genes and microRNA targets triggered by multiple mechanisms of genomic duplications in soybean. Plant Cell 27: 546-562.
   

   关注我们：

   
   CGM网站: cgmonline.co
   YOUTUBE频道: Chinese Genomics Meet-up
   微信群: 请添加微信好友beckyhao13，并注明”CGM”