探索微观世界的 “宏”大秘密 - 图2
CGM将于2019年5月1日星期三举办第52期在线沙龙活动。我们邀请了陈林兴博士来做一期题为 “**Genome-resolved metagenomics(解码宏基因组**” 的学术报告。YouTube直播开始时间是太平洋时间 (Pacific Time) 下午6点。请点击文末阅读原文,前往CGM网站观看直播。国内的朋友也请留意CGM官网,录播视频会在直播结束以后上线哦!

嘉宾简介:

探索微观世界的 “宏”大秘密 - 图3

陈林兴博士在中山大学生命科学学院接受了本硕博教育,于2015年获得环境科学专业博士学位,现在 UC Berkeley IGI (Innovative Genomics Institute) 的Jill F. Banfield 实验室从事博士后研究工作。研究领域主要是使用宏基因组学手段研究微生物噬菌体的基因组和CRISPR-Cas systems。

摘要概述(嘉宾提供):

微生物的物种和功能多样性是微生物学研究的主旨,微生物的分离培养技术为我们在这两个方面的认识奠定了坚实的基础。然而,绝大部分的微生物是不可培养的,这极大地限制了微生物学研究的进展,同时也催生了多种基于免培养的微生物研究方法,宏基因组学即是其中之一。
Genome-resolved metagenomics 是以获得微生物基因组(Metagenome-assembled genomes, MAGs) 为手段,进而在基因组水平对物种和功能多样性进行分析的宏基因组学研究方法。从 2004 年第一篇 MAGs 文章发表以来,越来越多的微生物基因组通过此方法被获得,如最近人类肠胃微生物研究,一次性发表超过 6 万个基因组。殊不知,如此疯狂输出的背后,隐藏了诸多问题。
本报告将简单介绍 Genome-resolved metagenomics 的基本原理和分析流程,优势和缺点,同时对未来的研究方向进行一些展望。

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