环状RNA(circRNA)作为一类新兴的生物标志物,已证明与许多基本生命过程和疾病(尤其是癌症)有关。然而,目前可用的检测方法的各种局限性严重限制了与使用circRNA作为生物标记物的circRNA生物学功能和疾病诊断相关的研究的发展。通过专门设计一对精确识别circRNA连接序列的茎环引物(SLP)北京科技大学的研究人员首先建立了SLP诱导的双指数扩增方法,用于对circRNA进行灵敏和特异性检测,并能够直接区分circRNA和线性RNA。通过在热循环中扩展SLP,一个circRNA可以生成大量的双茎环结构DNA,从而可以启动随后的等温扩增,从而导致低至10 aM circRNA的灵敏检测,这是检测sRNA的最灵敏方法。到目前为止的circRNA检测。所提出的方法已成功地用于均相溶液中多种癌细胞中circRNA的检测,无需任何分离步骤。

    通过精确识别特定的连接位点超灵敏检测环状RNA | RNA-Seq博客 - 图1

    Zhang P,Gao K,Liang Y,Su F,Wang F,Li Z.(2020)通过使用茎环引物诱导的双指数扩增准确识别特异性连接位点,对环状RNA进行超灵敏检测Talanta [Epub提前发行]。[ 摘要 ]