安装

  1. conda install jalview

或者也可以直接下载图形化软件。
https://www.jalview.org/getdown/release/
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查看

  1. jalview -open muscle_output.fasta

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或直接将导出的文件输入到jalview中。

计算

在calculate中，可以对多序列比对的序列做发生树以及双序列比对和主成分分析。
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编辑

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还可以直接点击某个序列，对其选择后进行切除等操作。