IMPC(International Mouse Phenotyping Consortium) 国际小鼠表型联盟

一 IMPC 数据下载

https://www.mousephenotype.org/data/release

1 生存性（viabilityReport）

  • Lethal - 完全致死
  • Viable - 可存活
  • Subviable - 可能致死（）

image.png

2 表型（phenotypeOverviewPerGeneReport）

image.png

二 基因转换（HGNC）

IMPC下载的数据中Gene Symbol是小鼠的(GRCm38) 要想应用于人的基因，还需进行基因名称的转换(同源基因转换) https://www.mousephenotype.org/help/faqs/analyses/how-are-mouse-human-orthologues-obtained/

HGNC提供了MGD_ID->HGNC symbol的转换
库文件：