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数据质量评估（需要掌握）

FastQC主页：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/
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数据质控-fastqc的常用参数

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http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/Help/

fastqc运行

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任务管理

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1，任务投递：运行前台程序, 到2; 或者 nohup, & 后台运行 到 4,5.
2，前台转后台： ctrl + Z 暂停，jobs 查看任务ID， 然后 bg %（任务ID）（任务开始运行）
3，后台转前台： fg %(任务ID) （诶 就是玩）
4，不想运行了：ctrl + C（杀前台程序） 或 kill -9 <强制结束任务> %(任务ID) 或PID（可杀后台程序）
5 ，判断任务完成：top，jobs查看是否还在运行， ls 看对应结果生成，log文件

查看结果

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基础统计信息

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重复分布

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过表达reads

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接头含量

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数据过滤

过滤标准

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过滤软件

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过滤结果

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