与其他工具比较
与R/R库的比较
由于 pandas 旨在为人们提供可以替代R的大量数据操作和分析的功能,因此本章节会提供较为详细的R语言)的介绍以及与相关的许多第三方库的对比说明,比如我们的 pandas 库。在与R和CRAN库的比较中,我们关注以下事项:
- 功能/灵活性:每个工具可以/不可以做什么
- 性能:操作速度有多快。硬性数字/基准是优选的
- 易于使用:一种工具更容易/更难使用(您可能需要对此进行判断,并进行并排代码比较)
此页面还为这些R包的用户提供了一些翻译指南。
要将 DataFrame 对象从 pandas 转化为到 R 的数据类型,有一个选择是采用HDF5文件,请参阅外部兼容性示例。
快速参考
我们将从快速参考指南开始,将dplyr与pandas等效的一些常见R操作配对。
查询、过滤、采样
| R | Pandas |
|---|---|
| dim(df) | df.shape |
| head(df) | df.head() |
| slice(df, 1:10) | df.iloc[:9] |
| filter(df, col1 == 1, col2 == 1) | df.query(‘col1 == 1 & col2 == 1’) |
| df[df$col1 == 1 & df$col2 == 1,] | df[(df.col1 == 1) & (df.col2 == 1)] |
| select(df, col1, col2) | df[[‘col1’, ‘col2’]] |
| select(df, col1:col3) | df.loc[:, ‘col1’:’col3’] |
| select(df, -(col1:col3)) | df.drop(cols_to_drop, axis=1)但是看[1] |
| distinct(select(df, col1)) | df[[‘col1’]].drop_duplicates() |
| distinct(select(df, col1, col2)) | df[[‘col1’, ‘col2’]].drop_duplicates() |
| sample_n(df, 10) | df.sample(n=10) |
| sample_frac(df, 0.01) | df.sample(frac=0.01) |
::: tip Note
R表示列的子集 (select(df,col1:col3) 的缩写更接近 Pandas 的写法,如果您有列的列表,例如 df[cols[1:3] 或 df.drop(cols[1:3]),按列名执行此操作可能会引起混乱。
:::
排序
| R | Pandas |
|---|---|
| arrange(df, col1, col2) | df.sort_values([‘col1’, ‘col2’]) |
| arrange(df, desc(col1)) | df.sort_values(‘col1’, ascending=False) |
变换
| R | Pandas |
|---|---|
| select(df, col_one = col1) | df.rename(columns={‘col1’: ‘col_one’})[‘col_one’] |
| rename(df, col_one = col1) | df.rename(columns={‘col1’: ‘col_one’}) |
| mutate(df, c=a-b) | df.assign(c=df.a-df.b) |
分组和组合
| R | Pandas |
|---|---|
| summary(df) | df.describe() |
| gdf <- group_by(df, col1) | gdf = df.groupby(‘col1’) |
| summarise(gdf, avg=mean(col1, na.rm=TRUE)) | df.groupby(‘col1’).agg({‘col1’: ‘mean’}) |
| summarise(gdf, total=sum(col1)) | df.groupby(‘col1’).sum() |
基本的R用法
用Rc方法来进行切片操作
R使您可以轻松地按名称访问列(data.frame)
df <- data.frame(a=rnorm(5), b=rnorm(5), c=rnorm(5), d=rnorm(5), e=rnorm(5))df[, c("a", "c", "e")]
或整数位置
df <- data.frame(matrix(rnorm(1000), ncol=100))df[, c(1:10, 25:30, 40, 50:100)]
按名称选择多个pandas的列非常简单
In [1]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(10, 3), columns=list('abc'))In [2]: df[['a', 'c']]Out[2]:a c0 0.469112 -1.5090591 -1.135632 -0.1732152 0.119209 -0.8618493 -2.104569 1.0718044 0.721555 -1.0395755 0.271860 0.5670206 0.276232 -0.6736907 0.113648 0.5249888 0.404705 -1.7150029 -1.039268 -1.157892In [3]: df.loc[:, ['a', 'c']]Out[3]:a c0 0.469112 -1.5090591 -1.135632 -0.1732152 0.119209 -0.8618493 -2.104569 1.0718044 0.721555 -1.0395755 0.271860 0.5670206 0.276232 -0.6736907 0.113648 0.5249888 0.404705 -1.7150029 -1.039268 -1.157892
通过整数位置选择多个不连续的列可以通过iloc索引器属性和 numpy.r_ 的组合来实现。
In [4]: named = list('abcdefg')In [5]: n = 30In [6]: columns = named + np.arange(len(named), n).tolist()In [7]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(n, n), columns=columns)In [8]: df.iloc[:, np.r_[:10, 24:30]]Out[8]:a b c d e f g 7 8 9 24 25 26 27 28 290 -1.344312 0.844885 1.075770 -0.109050 1.643563 -1.469388 0.357021 -0.674600 -1.776904 -0.968914 -1.170299 -0.226169 0.410835 0.813850 0.132003 -0.8273171 -0.076467 -1.187678 1.130127 -1.436737 -1.413681 1.607920 1.024180 0.569605 0.875906 -2.211372 0.959726 -1.110336 -0.619976 0.149748 -0.732339 0.6877382 0.176444 0.403310 -0.154951 0.301624 -2.179861 -1.369849 -0.954208 1.462696 -1.743161 -0.826591 0.084844 0.432390 1.519970 -0.493662 0.600178 0.2742303 0.132885 -0.023688 2.410179 1.450520 0.206053 -0.251905 -2.213588 1.063327 1.266143 0.299368 -2.484478 -0.281461 0.030711 0.109121 1.126203 -0.9773494 1.474071 -0.064034 -1.282782 0.781836 -1.071357 0.441153 2.353925 0.583787 0.221471 -0.744471 -1.197071 -1.066969 -0.303421 -0.858447 0.306996 -0.028665.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...25 1.492125 -0.068190 0.681456 1.221829 -0.434352 1.204815 -0.195612 1.251683 -1.040389 -0.796211 1.944517 0.042344 -0.307904 0.428572 0.880609 0.48764526 0.725238 0.624607 -0.141185 -0.143948 -0.328162 2.095086 -0.608888 -0.926422 1.872601 -2.513465 -0.846188 1.190624 0.778507 1.008500 1.424017 0.71711027 1.262419 1.950057 0.301038 -0.933858 0.814946 0.181439 -0.110015 -2.364638 -1.584814 0.307941 -1.341814 0.334281 -0.162227 1.007824 2.826008 1.45838328 -1.585746 -0.899734 0.921494 -0.211762 -0.059182 0.058308 0.915377 -0.696321 0.150664 -3.060395 0.403620 -0.026602 -0.240481 0.577223 -1.088417 0.32668729 -0.986248 0.169729 -1.158091 1.019673 0.646039 0.917399 -0.010435 0.366366 0.922729 0.869610 -1.209247 -0.671466 0.332872 -2.013086 -1.602549 0.333109[30 rows x 16 columns]
aggregate
在R中,您可能希望将数据分成几个子集,并计算每个子集的平均值。使用名为df的data.frame并将其分成组by1和by2:
df <- data.frame(v1 = c(1,3,5,7,8,3,5,NA,4,5,7,9),v2 = c(11,33,55,77,88,33,55,NA,44,55,77,99),by1 = c("red", "blue", 1, 2, NA, "big", 1, 2, "red", 1, NA, 12),by2 = c("wet", "dry", 99, 95, NA, "damp", 95, 99, "red", 99, NA, NA))aggregate(x=df[, c("v1", "v2")], by=list(mydf2$by1, mydf2$by2), FUN = mean)
该groupby()方法类似于基本R的 aggregate
函数。
In [9]: df = pd.DataFrame(...: {'v1': [1, 3, 5, 7, 8, 3, 5, np.nan, 4, 5, 7, 9],...: 'v2': [11, 33, 55, 77, 88, 33, 55, np.nan, 44, 55, 77, 99],...: 'by1': ["red", "blue", 1, 2, np.nan, "big", 1, 2, "red", 1, np.nan, 12],...: 'by2': ["wet", "dry", 99, 95, np.nan, "damp", 95, 99, "red", 99, np.nan,...: np.nan]})...:In [10]: g = df.groupby(['by1', 'by2'])In [11]: g[['v1', 'v2']].mean()Out[11]:v1 v2by1 by21 95 5.0 55.099 5.0 55.02 95 7.0 77.099 NaN NaNbig damp 3.0 33.0blue dry 3.0 33.0red red 4.0 44.0wet 1.0 11.0
有关更多详细信息和示例,请参阅groupby文档。
match/ %in%
在R中选择数据的常用方法是使用%in%使用该函数定义的数据match。运算符%in%用于返回指示是否存在匹配的逻辑向量:
s <- 0:4s %in% c(2,4)
该isin()方法类似于R %in%运算符:
In [12]: s = pd.Series(np.arange(5), dtype=np.float32)In [13]: s.isin([2, 4])Out[13]:0 False1 False2 True3 False4 Truedtype: bool
该match函数返回其第二个参数匹配位置的向量:
s <- 0:4match(s, c(2,4))
有关更多详细信息和示例,请参阅重塑文档。
tapply
tapply类似于aggregate,但数据可以是一个参差不齐的数组,因为子类大小可能是不规则的。使用调用的data.frame
baseball,并根据数组检索信息team:
baseball <-data.frame(team = gl(5, 5,labels = paste("Team", LETTERS[1:5])),player = sample(letters, 25),batting.average = runif(25, .200, .400))tapply(baseball$batting.average, baseball.example$team,max)
在pandas我们可以使用pivot_table()方法来处理这个:
In [14]: import randomIn [15]: import stringIn [16]: baseball = pd.DataFrame(....: {'team': ["team %d" % (x + 1) for x in range(5)] * 5,....: 'player': random.sample(list(string.ascii_lowercase), 25),....: 'batting avg': np.random.uniform(.200, .400, 25)})....:In [17]: baseball.pivot_table(values='batting avg', columns='team', aggfunc=np.max)Out[17]:team team 1 team 2 team 3 team 4 team 5batting avg 0.352134 0.295327 0.397191 0.394457 0.396194
有关更多详细信息和示例,请参阅重塑文档。
subset
该query()方法类似于基本R subset
函数。在R中,您可能希望获取data.frame一列的值小于另一列的值的行:
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))subset(df, a <= b)df[df$a <= df$b,] # note the comma
在pandas,有几种方法可以执行子集化。您可以使用
query()或传递表达式,就像它是索引/切片以及标准布尔索引一样:
In [18]: df = pd.DataFrame({'a': np.random.randn(10), 'b': np.random.randn(10)})In [19]: df.query('a <= b')Out[19]:a b1 0.174950 0.5528872 -0.023167 0.1480843 -0.495291 -0.3002184 -0.860736 0.1973785 -1.134146 1.7207807 -0.290098 0.0835158 0.238636 0.946550In [20]: df[df.a <= df.b]Out[20]:a b1 0.174950 0.5528872 -0.023167 0.1480843 -0.495291 -0.3002184 -0.860736 0.1973785 -1.134146 1.7207807 -0.290098 0.0835158 0.238636 0.946550In [21]: df.loc[df.a <= df.b]Out[21]:a b1 0.174950 0.5528872 -0.023167 0.1480843 -0.495291 -0.3002184 -0.860736 0.1973785 -1.134146 1.7207807 -0.290098 0.0835158 0.238636 0.946550
有关更多详细信息和示例,请参阅查询文档。
with
使用df带有列的R中调用的data.frame的表达式a,
b将使用with如下方式进行求值:
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))with(df, a + b)df$a + df$b # same as the previous expression
在pandas等效表达式中,使用该
eval()方法将是:
In [22]: df = pd.DataFrame({'a': np.random.randn(10), 'b': np.random.randn(10)})In [23]: df.eval('a + b')Out[23]:0 -0.0914301 -2.4838902 -0.2527283 -0.6264444 -0.2617405 2.1495036 -0.3322147 0.7993318 -2.3772459 2.104677dtype: float64In [24]: df.a + df.b # same as the previous expressionOut[24]:0 -0.0914301 -2.4838902 -0.2527283 -0.6264444 -0.2617405 2.1495036 -0.3322147 0.7993318 -2.3772459 2.104677dtype: float64
在某些情况下,eval()将比纯Python中的评估快得多。有关更多详细信息和示例,请参阅eval文档。
plyr
plyr是用于数据分析的拆分应用组合策略的R库。这些函数围绕R,a
for arrays,lfor lists和dfor中的三个数据结构data.frame。下表显示了如何在Python中映射这些数据结构。
| R | Python |
|---|---|
| array | list |
| lists | 字典(dist)或对象列表(list of objects) |
| data.frame | dataframe |
ddply
在R中使用名为df的data.frame的表达式,比如您有一个希望按月汇总x的需求:
require(plyr)df <- data.frame(x = runif(120, 1, 168),y = runif(120, 7, 334),z = runif(120, 1.7, 20.7),month = rep(c(5,6,7,8),30),week = sample(1:4, 120, TRUE))ddply(df, .(month, week), summarize,mean = round(mean(x), 2),sd = round(sd(x), 2))
在pandas等效表达式中,使用该
groupby()方法将是:
In [25]: df = pd.DataFrame({'x': np.random.uniform(1., 168., 120),....: 'y': np.random.uniform(7., 334., 120),....: 'z': np.random.uniform(1.7, 20.7, 120),....: 'month': [5, 6, 7, 8] * 30,....: 'week': np.random.randint(1, 4, 120)})....:In [26]: grouped = df.groupby(['month', 'week'])In [27]: grouped['x'].agg([np.mean, np.std])Out[27]:mean stdmonth week5 1 63.653367 40.6019652 78.126605 53.3424003 92.091886 57.6301106 1 81.747070 54.3392182 70.971205 54.6872873 100.968344 54.0100817 1 61.576332 38.8442742 61.733510 48.2090133 71.688795 37.5956388 1 62.741922 34.6181532 91.774627 49.7902023 73.936856 60.773900
有关更多详细信息和示例,请参阅groupby文档。
重塑/ reshape2
melt.array
使用a在R中调用的3维数组的表达式,您希望将其融合到data.frame中:
a <- array(c(1:23, NA), c(2,3,4))data.frame(melt(a))
在Python中,既然a是一个列表,你可以简单地使用列表理解。
In [28]: a = np.array(list(range(1, 24)) + [np.NAN]).reshape(2, 3, 4)In [29]: pd.DataFrame([tuple(list(x) + [val]) for x, val in np.ndenumerate(a)])Out[29]:0 1 2 30 0 0 0 1.01 0 0 1 2.02 0 0 2 3.03 0 0 3 4.04 0 1 0 5.0.. .. .. .. ...19 1 1 3 20.020 1 2 0 21.021 1 2 1 22.022 1 2 2 23.023 1 2 3 NaN[24 rows x 4 columns]
melt.list
使用aR中调用的列表的表达式,您希望将其融合到data.frame中:
a <- as.list(c(1:4, NA))data.frame(melt(a))
在Python中,此列表将是元组列表,因此
DataFrame()方法会根据需要将其转换为数据帧。
In [30]: a = list(enumerate(list(range(1, 5)) + [np.NAN]))In [31]: pd.DataFrame(a)Out[31]:0 10 0 1.01 1 2.02 2 3.03 3 4.04 4 NaN
有关更多详细信息和示例,请参阅“进入数据结构”文档。
melt.data.frame
使用cheese在R中调用的data.frame的表达式,您要在其中重新整形data.frame:
cheese <- data.frame(first = c('John', 'Mary'),last = c('Doe', 'Bo'),height = c(5.5, 6.0),weight = c(130, 150))melt(cheese, id=c("first", "last"))
在Python中,该melt()方法是R等价物:
In [32]: cheese = pd.DataFrame({'first': ['John', 'Mary'],....: 'last': ['Doe', 'Bo'],....: 'height': [5.5, 6.0],....: 'weight': [130, 150]})....:In [33]: pd.melt(cheese, id_vars=['first', 'last'])Out[33]:first last variable value0 John Doe height 5.51 Mary Bo height 6.02 John Doe weight 130.03 Mary Bo weight 150.0In [34]: cheese.set_index(['first', 'last']).stack() # alternative wayOut[34]:first lastJohn Doe height 5.5weight 130.0Mary Bo height 6.0weight 150.0dtype: float64
有关更多详细信息和示例,请参阅重塑文档。
cast
在R中acast是一个表达式,它使用df在R中调用的data.frame 来转换为更高维的数组:
df <- data.frame(x = runif(12, 1, 168),y = runif(12, 7, 334),z = runif(12, 1.7, 20.7),month = rep(c(5,6,7),4),week = rep(c(1,2), 6))mdf <- melt(df, id=c("month", "week"))acast(mdf, week ~ month ~ variable, mean)
在Python中,最好的方法是使用pivot_table():
In [35]: df = pd.DataFrame({'x': np.random.uniform(1., 168., 12),....: 'y': np.random.uniform(7., 334., 12),....: 'z': np.random.uniform(1.7, 20.7, 12),....: 'month': [5, 6, 7] * 4,....: 'week': [1, 2] * 6})....:In [36]: mdf = pd.melt(df, id_vars=['month', 'week'])In [37]: pd.pivot_table(mdf, values='value', index=['variable', 'week'],....: columns=['month'], aggfunc=np.mean)....:Out[37]:month 5 6 7variable weekx 1 93.888747 98.762034 55.2196732 94.391427 38.112932 83.942781y 1 94.306912 279.454811 227.8404492 87.392662 193.028166 173.899260z 1 11.016009 10.079307 16.1705492 8.476111 17.638509 19.003494
类似地dcast,使用dfR中调用的data.frame 来基于Animal和聚合信息FeedType:
df <- data.frame(Animal = c('Animal1', 'Animal2', 'Animal3', 'Animal2', 'Animal1','Animal2', 'Animal3'),FeedType = c('A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'B', 'A'),Amount = c(10, 7, 4, 2, 5, 6, 2))dcast(df, Animal ~ FeedType, sum, fill=NaN)# Alternative method using base Rwith(df, tapply(Amount, list(Animal, FeedType), sum))
Python可以通过两种不同的方式处理它。首先,类似于上面使用pivot_table():
In [38]: df = pd.DataFrame({....: 'Animal': ['Animal1', 'Animal2', 'Animal3', 'Animal2', 'Animal1',....: 'Animal2', 'Animal3'],....: 'FeedType': ['A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'B', 'A'],....: 'Amount': [10, 7, 4, 2, 5, 6, 2],....: })....:In [39]: df.pivot_table(values='Amount', index='Animal', columns='FeedType',....: aggfunc='sum')....:Out[39]:FeedType A BAnimalAnimal1 10.0 5.0Animal2 2.0 13.0Animal3 6.0 NaN
第二种方法是使用该groupby()方法:
In [40]: df.groupby(['Animal', 'FeedType'])['Amount'].sum()Out[40]:Animal FeedTypeAnimal1 A 10B 5Animal2 A 2B 13Animal3 A 6Name: Amount, dtype: int64
有关更多详细信息和示例,请参阅重新整形文档或groupby文档。
factor
pandas具有分类数据的数据类型。
cut(c(1,2,3,4,5,6), 3)factor(c(1,2,3,2,2,3))
在Pandas,这是完成与pd.cut和astype("category"):
In [41]: pd.cut(pd.Series([1, 2, 3, 4, 5, 6]), 3)Out[41]:0 (0.995, 2.667]1 (0.995, 2.667]2 (2.667, 4.333]3 (2.667, 4.333]4 (4.333, 6.0]5 (4.333, 6.0]dtype: categoryCategories (3, interval[float64]): [(0.995, 2.667] < (2.667, 4.333] < (4.333, 6.0]]In [42]: pd.Series([1, 2, 3, 2, 2, 3]).astype("category")Out[42]:0 11 22 33 24 25 3dtype: categoryCategories (3, int64): [1, 2, 3]
有关更多详细信息和示例,请参阅分类介绍和 API文档。还有一个关于R因子差异的文档 。
与SQL比较
由于许多潜在的 pandas 用户对SQL有一定的了解 ,因此本页面旨在提供一些使用pandas如何执行各种SQL操作的示例。
如果您是 pandas 的新手,您可能需要先阅读十分钟入门Pandas 以熟悉本库。
按照惯例,我们按如下方式导入 pandas 和 NumPy:
In [1]: import pandas as pdIn [2]: import numpy as np
大多数示例将使用tipspandas测试中找到的数据集。我们将数据读入名为tips的DataFrame中,并假设我们有一个具有相同名称和结构的数据库表。
In [3]: url = ('https://raw.github.com/pandas-dev'...: '/pandas/master/pandas/tests/data/tips.csv')...:In [4]: tips = pd.read_csv(url)In [5]: tips.head()Out[5]:total_bill tip sex smoker day time size0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 21 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 32 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
SELECT
在SQL中,使用您要选择的以逗号分隔的列列表(或*
选择所有列)来完成选择:
SELECT total_bill, tip, smoker, timeFROM tipsLIMIT 5;
使用pandas,通过将列名列表传递给DataFrame来完成列选择:
In [6]: tips[['total_bill', 'tip', 'smoker', 'time']].head(5)Out[6]:total_bill tip smoker time0 16.99 1.01 No Dinner1 10.34 1.66 No Dinner2 21.01 3.50 No Dinner3 23.68 3.31 No Dinner4 24.59 3.61 No Dinner
在没有列名列表的情况下调用DataFrame将显示所有列(类似于SQL*)。
WHERE
SQL中的过滤是通过WHERE子句完成的。
SELECT *FROM tipsWHERE time = 'Dinner'LIMIT 5;
DataFrame可以通过多种方式进行过滤; 最直观的是使用 布尔索引。
In [7]: tips[tips['time'] == 'Dinner'].head(5)Out[7]:total_bill tip sex smoker day time size0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 21 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 32 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
上面的语句只是将一个 Series 的 True / False 对象传递给 DataFrame,返回所有带有True的行。
In [8]: is_dinner = tips['time'] == 'Dinner'In [9]: is_dinner.value_counts()Out[9]:True 176False 68Name: time, dtype: int64In [10]: tips[is_dinner].head(5)Out[10]:total_bill tip sex smoker day time size0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 21 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 32 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
就像SQL的OR和AND一样,可以使用|将多个条件传递给DataFrame (OR)和&(AND)。
-- tips of more than $5.00 at Dinner mealsSELECT *FROM tipsWHERE time = 'Dinner' AND tip > 5.00;
# tips of more than $5.00 at Dinner mealsIn [11]: tips[(tips['time'] == 'Dinner') & (tips['tip'] > 5.00)]Out[11]:total_bill tip sex smoker day time size23 39.42 7.58 Male No Sat Dinner 444 30.40 5.60 Male No Sun Dinner 447 32.40 6.00 Male No Sun Dinner 452 34.81 5.20 Female No Sun Dinner 459 48.27 6.73 Male No Sat Dinner 4116 29.93 5.07 Male No Sun Dinner 4155 29.85 5.14 Female No Sun Dinner 5170 50.81 10.00 Male Yes Sat Dinner 3172 7.25 5.15 Male Yes Sun Dinner 2181 23.33 5.65 Male Yes Sun Dinner 2183 23.17 6.50 Male Yes Sun Dinner 4211 25.89 5.16 Male Yes Sat Dinner 4212 48.33 9.00 Male No Sat Dinner 4214 28.17 6.50 Female Yes Sat Dinner 3239 29.03 5.92 Male No Sat Dinner 3
-- tips by parties of at least 5 diners OR bill total was more than $45SELECT *FROM tipsWHERE size >= 5 OR total_bill > 45;
# tips by parties of at least 5 diners OR bill total was more than $45In [12]: tips[(tips['size'] >= 5) | (tips['total_bill'] > 45)]Out[12]:total_bill tip sex smoker day time size59 48.27 6.73 Male No Sat Dinner 4125 29.80 4.20 Female No Thur Lunch 6141 34.30 6.70 Male No Thur Lunch 6142 41.19 5.00 Male No Thur Lunch 5143 27.05 5.00 Female No Thur Lunch 6155 29.85 5.14 Female No Sun Dinner 5156 48.17 5.00 Male No Sun Dinner 6170 50.81 10.00 Male Yes Sat Dinner 3182 45.35 3.50 Male Yes Sun Dinner 3185 20.69 5.00 Male No Sun Dinner 5187 30.46 2.00 Male Yes Sun Dinner 5212 48.33 9.00 Male No Sat Dinner 4216 28.15 3.00 Male Yes Sat Dinner 5
In [13]: frame = pd.DataFrame({'col1': ['A', 'B', np.NaN, 'C', 'D'],....: 'col2': ['F', np.NaN, 'G', 'H', 'I']})....:In [14]: frameOut[14]:col1 col20 A F1 B NaN2 NaN G3 C H4 D I
假设我们有一个与上面的DataFrame结构相同的表。我们只能col2通过以下查询看到IS NULL 的记录:
SELECT *FROM frameWHERE col2 IS NULL;
In [15]: frame[frame['col2'].isna()]Out[15]:col1 col21 B NaN
获取col1IS NOT NULL的项目可以完成notna()。
SELECT *FROM frameWHERE col1 IS NOT NULL;
In [16]: frame[frame['col1'].notna()]Out[16]:col1 col20 A F1 B NaN3 C H4 D I
GROUP BY
在pandas中,SQL的GROUP BY操作使用类似命名的
groupby()方法执行。groupby()通常是指我们想要将数据集拆分成组,应用某些功能(通常是聚合),然后将这些组合在一起的过程。
常见的SQL操作是获取整个数据集中每个组中的记录数。例如,有一个需要向我们提供提示中的性别的数量的查询语句:
SELECT sex, count(*)FROM tipsGROUP BY sex;/*Female 87Male 157*/
在 pandas 中可以这样:
In [17]: tips.groupby('sex').size()Out[17]:sexFemale 87Male 157dtype: int64
请注意,在我们使用的pandas代码中size(),没有
count()。这是因为
count()将函数应用于每个列,返回每个列中的记录数。not null
In [18]: tips.groupby('sex').count()Out[18]:total_bill tip smoker day time sizesexFemale 87 87 87 87 87 87Male 157 157 157 157 157 157
或者,我们可以将该count()方法应用于单个列:
In [19]: tips.groupby('sex')['total_bill'].count()Out[19]:sexFemale 87Male 157Name: total_bill, dtype: int64
也可以一次应用多个功能。例如,假设我们希望查看提示量与星期几的不同之处 - agg()允许您将字典传递给分组的DataFrame,指示要应用于特定列的函数。
SELECT day, AVG(tip), COUNT(*)FROM tipsGROUP BY day;/*Fri 2.734737 19Sat 2.993103 87Sun 3.255132 76Thur 2.771452 62*/
In [20]: tips.groupby('day').agg({'tip': np.mean, 'day': np.size})Out[20]:tip daydayFri 2.734737 19Sat 2.993103 87Sun 3.255132 76Thur 2.771452 62
通过将列列表传递给groupby()方法来完成多个列的分组
。
SELECT smoker, day, COUNT(*), AVG(tip)FROM tipsGROUP BY smoker, day;/*smoker dayNo Fri 4 2.812500Sat 45 3.102889Sun 57 3.167895Thur 45 2.673778Yes Fri 15 2.714000Sat 42 2.875476Sun 19 3.516842Thur 17 3.030000*/
In [21]: tips.groupby(['smoker', 'day']).agg({'tip': [np.size, np.mean]})Out[21]:tipsize meansmoker dayNo Fri 4.0 2.812500Sat 45.0 3.102889Sun 57.0 3.167895Thur 45.0 2.673778Yes Fri 15.0 2.714000Sat 42.0 2.875476Sun 19.0 3.516842Thur 17.0 3.030000
JOIN
可以使用join()或执行JOIN merge()。默认情况下,
join()将在其索引上加入DataFrame。每个方法都有参数,允许您指定要执行的连接类型(LEFT,RIGHT,INNER,FULL)或要连接的列(列名称或索引)。
In [22]: df1 = pd.DataFrame({'key': ['A', 'B', 'C', 'D'],....: 'value': np.random.randn(4)})....:In [23]: df2 = pd.DataFrame({'key': ['B', 'D', 'D', 'E'],....: 'value': np.random.randn(4)})....:
假设我们有两个与DataFrames名称和结构相同的数据库表。
现在让我们来看看各种类型的JOIN。
INNER JOIN
SELECT *FROM df1INNER JOIN df2ON df1.key = df2.key;
# merge performs an INNER JOIN by defaultIn [24]: pd.merge(df1, df2, on='key')Out[24]:key value_x value_y0 B -0.282863 1.2121121 D -1.135632 -0.1732152 D -1.135632 0.119209
merge() 当您想要将一个DataFrame列与另一个DataFrame索引连接时,还会为这些情况提供参数。
In [25]: indexed_df2 = df2.set_index('key')In [26]: pd.merge(df1, indexed_df2, left_on='key', right_index=True)Out[26]:key value_x value_y1 B -0.282863 1.2121123 D -1.135632 -0.1732153 D -1.135632 0.119209
LEFT OUTER JOIN
-- show all records from df1SELECT *FROM df1LEFT OUTER JOIN df2ON df1.key = df2.key;
# show all records from df1In [27]: pd.merge(df1, df2, on='key', how='left')Out[27]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.119209
RIGHT JOIN
-- show all records from df2SELECT *FROM df1RIGHT OUTER JOIN df2ON df1.key = df2.key;
# show all records from df2In [28]: pd.merge(df1, df2, on='key', how='right')Out[28]:key value_x value_y0 B -0.282863 1.2121121 D -1.135632 -0.1732152 D -1.135632 0.1192093 E NaN -1.044236
FULL JOIN
pandas还允许显示数据集两侧的FULL JOIN,无论连接列是否找到匹配项。在编写时,所有RDBMS(MySQL)都不支持FULL JOIN。
-- show all records from both tablesSELECT *FROM df1FULL OUTER JOIN df2ON df1.key = df2.key;
# show all records from both framesIn [29]: pd.merge(df1, df2, on='key', how='outer')Out[29]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.1192095 E NaN -1.044236
UNION
UNION ALL可以使用concat()。
In [30]: df1 = pd.DataFrame({'city': ['Chicago', 'San Francisco', 'New York City'],....: 'rank': range(1, 4)})....:In [31]: df2 = pd.DataFrame({'city': ['Chicago', 'Boston', 'Los Angeles'],....: 'rank': [1, 4, 5]})....:
SELECT city, rankFROM df1UNION ALLSELECT city, rankFROM df2;/*city rankChicago 1San Francisco 2New York City 3Chicago 1Boston 4Los Angeles 5*/
In [32]: pd.concat([df1, df2])Out[32]:city rank0 Chicago 11 San Francisco 22 New York City 30 Chicago 11 Boston 42 Los Angeles 5
SQL的UNION类似于UNION ALL,但是UNION将删除重复的行。
SELECT city, rankFROM df1UNIONSELECT city, rankFROM df2;-- notice that there is only one Chicago record this time/*city rankChicago 1San Francisco 2New York City 3Boston 4Los Angeles 5*/
在 pandas 中,您可以concat()结合使用
drop_duplicates()。
In [33]: pd.concat([df1, df2]).drop_duplicates()Out[33]:city rank0 Chicago 11 San Francisco 22 New York City 31 Boston 42 Los Angeles 5
Pandas等同于某些SQL分析和聚合函数
带有偏移量的前N行
-- MySQLSELECT * FROM tipsORDER BY tip DESCLIMIT 10 OFFSET 5;
In [34]: tips.nlargest(10 + 5, columns='tip').tail(10)Out[34]:total_bill tip sex smoker day time size183 23.17 6.50 Male Yes Sun Dinner 4214 28.17 6.50 Female Yes Sat Dinner 347 32.40 6.00 Male No Sun Dinner 4239 29.03 5.92 Male No Sat Dinner 388 24.71 5.85 Male No Thur Lunch 2181 23.33 5.65 Male Yes Sun Dinner 244 30.40 5.60 Male No Sun Dinner 452 34.81 5.20 Female No Sun Dinner 485 34.83 5.17 Female No Thur Lunch 4211 25.89 5.16 Male Yes Sat Dinner 4
每组前N行
-- Oracle's ROW_NUMBER() analytic functionSELECT * FROM (SELECTt.*,ROW_NUMBER() OVER(PARTITION BY day ORDER BY total_bill DESC) AS rnFROM tips t)WHERE rn < 3ORDER BY day, rn;
In [35]: (tips.assign(rn=tips.sort_values(['total_bill'], ascending=False)....: .groupby(['day'])....: .cumcount() + 1)....: .query('rn < 3')....: .sort_values(['day', 'rn']))....:Out[35]:total_bill tip sex smoker day time size rn95 40.17 4.73 Male Yes Fri Dinner 4 190 28.97 3.00 Male Yes Fri Dinner 2 2170 50.81 10.00 Male Yes Sat Dinner 3 1212 48.33 9.00 Male No Sat Dinner 4 2156 48.17 5.00 Male No Sun Dinner 6 1182 45.35 3.50 Male Yes Sun Dinner 3 2197 43.11 5.00 Female Yes Thur Lunch 4 1142 41.19 5.00 Male No Thur Lunch 5 2
同样使用 rank (method =’first’) 函数
In [36]: (tips.assign(rnk=tips.groupby(['day'])['total_bill']....: .rank(method='first', ascending=False))....: .query('rnk < 3')....: .sort_values(['day', 'rnk']))....:Out[36]:total_bill tip sex smoker day time size rnk95 40.17 4.73 Male Yes Fri Dinner 4 1.090 28.97 3.00 Male Yes Fri Dinner 2 2.0170 50.81 10.00 Male Yes Sat Dinner 3 1.0212 48.33 9.00 Male No Sat Dinner 4 2.0156 48.17 5.00 Male No Sun Dinner 6 1.0182 45.35 3.50 Male Yes Sun Dinner 3 2.0197 43.11 5.00 Female Yes Thur Lunch 4 1.0142 41.19 5.00 Male No Thur Lunch 5 2.0
-- Oracle's RANK() analytic functionSELECT * FROM (SELECTt.*,RANK() OVER(PARTITION BY sex ORDER BY tip) AS rnkFROM tips tWHERE tip < 2)WHERE rnk < 3ORDER BY sex, rnk;
让我们找到每个性别组(等级<3)的提示(提示<2)。请注意,使用rank(method='min')函数时
rnk_min对于相同的提示保持不变
(如Oracle的RANK()函数)
In [37]: (tips[tips['tip'] < 2]....: .assign(rnk_min=tips.groupby(['sex'])['tip']....: .rank(method='min'))....: .query('rnk_min < 3')....: .sort_values(['sex', 'rnk_min']))....:Out[37]:total_bill tip sex smoker day time size rnk_min67 3.07 1.00 Female Yes Sat Dinner 1 1.092 5.75 1.00 Female Yes Fri Dinner 2 1.0111 7.25 1.00 Female No Sat Dinner 1 1.0236 12.60 1.00 Male Yes Sat Dinner 2 1.0237 32.83 1.17 Male Yes Sat Dinner 2 2.0
更新(UPDATE)
UPDATE tipsSET tip = tip*2WHERE tip < 2;
In [38]: tips.loc[tips['tip'] < 2, 'tip'] *= 2
删除(DELETE)
DELETE FROM tipsWHERE tip > 9;
在pandas中,我们选择应保留的行,而不是删除它们
In [39]: tips = tips.loc[tips['tip'] <= 9]
与SAS的比较
对于来自 SAS) 的潜在用户,本节旨在演示如何在 pandas 中做各种类似SAS的操作。
由于许多潜在的 pandas 用户对SQL有一定的了解,因此本页面旨在提供一些使用 pandas 如何执行各种SQL操作的示例。
如果您是 pandas 的新手,您可能需要先阅读十分钟入门Pandas 以熟悉本库。
按照惯例,我们按如下方式导入 pandas 和 NumPy:
In [1]: import pandas as pdIn [2]: import numpy as np
::: tip 注意
在本教程中,DataFrame将通过调用显示
pandas df.head(),它将显示该行的前N行(默认为5行)DataFrame。这通常用于交互式工作(例如Jupyter笔记本或终端) - SAS中的等价物将是:
proc print data=df(obs=5);run;
:::
数据结构
一般术语对照表
| Pandas | SAS |
|---|---|
| DataFrame | 数据集(data set) |
| column | 变量(variable) |
| row | 观察(observation) |
| groupby | BY-group |
| NaN | . |
DataFrame/ Series
A DataFramepandas类似于SAS数据集 - 具有标记列的二维数据源,可以是不同类型的。如本文档所示,几乎所有可以使用SAS DATA步骤应用于数据集的操作也可以在pandas中完成。
A Series是表示a的一列的数据结构
DataFrame。SAS没有针对单个列的单独数据结构,但通常,使用a Series类似于在DATA步骤中引用列。
Index
每一个DataFrame和Series有一个Index-这是对标签
的行数据。SAS没有完全类似的概念。除了在DATAstep(_N_)期间可以访问的隐式整数索引之外,数据集的行基本上是未标记的。
在pandas中,如果未指定索引,则默认情况下也使用整数索引(第一行= 0,第二行= 1,依此类推)。虽然使用标记Index或
MultiIndex可以启用复杂的分析,并且最终是 Pandas 理解的重要部分,但是对于这种比较,我们基本上会忽略它,
Index并且只是将其DataFrame视为列的集合。有关如何有效使用的更多信息,
请参阅索引文档Index。
数据输入/输出
从值构造DataFrame
通过将数据放在datalines语句之后并指定列名,可以从指定值构建SAS数据集。
data df;input x y;datalines;1 23 45 6;run;
DataFrame可以用许多不同的方式构造一个pandas ,但是对于少量的值,通常很方便将它指定为Python字典,其中键是列名,值是数据。
In [3]: df = pd.DataFrame({'x': [1, 3, 5], 'y': [2, 4, 6]})In [4]: dfOut[4]:x y0 1 21 3 42 5 6
读取外部数据
与SAS一样,pandas提供了从多种格式读取数据的实用程序。tips在pandas测试(csv)中找到的数据集将用于以下许多示例中。
SAS提供将csv数据读入数据集。PROC IMPORT
proc import datafile='tips.csv' dbms=csv out=tips replace;getnames=yes;run;
Pandas 方法是read_csv()类似的。
In [5]: url = ('https://raw.github.com/pandas-dev/'...: 'pandas/master/pandas/tests/data/tips.csv')...:In [6]: tips = pd.read_csv(url)In [7]: tips.head()Out[7]:total_bill tip sex smoker day time size0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 21 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 32 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
比如,可以使用许多参数来指定数据应该如何解析。例如,如果数据是由制表符分隔的,并且没有列名,那么pandas命令将是:PROC IMPORT````read_csv
tips = pd.read_csv('tips.csv', sep='\t', header=None)# alternatively, read_table is an alias to read_csv with tab delimitertips = pd.read_table('tips.csv', header=None)
除了text / csv之外,pandas还支持各种其他数据格式,如Excel,HDF5和SQL数据库。这些都是通过pd.read_*
函数读取的。有关更多详细信息,请参阅IO文档。
导出数据
在SAS中proc导入相反就是proc导出
proc export data=tips outfile='tips2.csv' dbms=csv;run;
类似地,在 Pandas ,相反read_csv是to_csv(),与其他的数据格式遵循类似的API。
tips.to_csv('tips2.csv')
数据操作
列上的操作
在该DATA步骤中,可以在新列或现有列上使用任意数学表达式。
data tips;set tips;total_bill = total_bill - 2;new_bill = total_bill / 2;run;
pandas 通过指定个体提供了类似的矢量化操作Series中DataFrame。可以以相同的方式分配新列。
In [8]: tips['total_bill'] = tips['total_bill'] - 2In [9]: tips['new_bill'] = tips['total_bill'] / 2.0In [10]: tips.head()Out[10]:total_bill tip sex smoker day time size new_bill0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2 7.4951 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 3 4.1702 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3 9.5053 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2 10.8404 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4 11.295
过滤
SAS中的过滤是通过一个或多个列上的if或where语句完成的。
data tips;set tips;if total_bill > 10;run;data tips;set tips;where total_bill > 10;/* equivalent in this case - where happens before theDATA step begins and can also be used in PROC statements */run;
DataFrame可以通过多种方式进行过滤; 最直观的是使用 布尔索引
In [11]: tips[tips['total_bill'] > 10].head()Out[11]:total_bill tip sex smoker day time size0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 22 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 45 23.29 4.71 Male No Sun Dinner 4
如果/那么逻辑
在SAS中,if / then逻辑可用于创建新列。
data tips;set tips;format bucket $4.;if total_bill < 10 then bucket = 'low';else bucket = 'high';run;
Pandas 中的相同操作可以使用where来自的方法来完成numpy。
In [12]: tips['bucket'] = np.where(tips['total_bill'] < 10, 'low', 'high')In [13]: tips.head()Out[13]:total_bill tip sex smoker day time size bucket0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2 high1 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 3 low2 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3 high3 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2 high4 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4 high
日期功能
SAS提供了各种功能来对日期/日期时间列进行操作。
data tips;set tips;format date1 date2 date1_plusmonth mmddyy10.;date1 = mdy(1, 15, 2013);date2 = mdy(2, 15, 2015);date1_year = year(date1);date2_month = month(date2);* shift date to beginning of next interval;date1_next = intnx('MONTH', date1, 1);* count intervals between dates;months_between = intck('MONTH', date1, date2);run;
等效的pandas操作如下所示。除了这些功能外,pandas还支持Base SAS中不具备的其他时间序列功能(例如重新采样和自定义偏移) - 有关详细信息,请参阅时间序列文档。
In [14]: tips['date1'] = pd.Timestamp('2013-01-15')In [15]: tips['date2'] = pd.Timestamp('2015-02-15')In [16]: tips['date1_year'] = tips['date1'].dt.yearIn [17]: tips['date2_month'] = tips['date2'].dt.monthIn [18]: tips['date1_next'] = tips['date1'] + pd.offsets.MonthBegin()In [19]: tips['months_between'] = (....: tips['date2'].dt.to_period('M') - tips['date1'].dt.to_period('M'))....:In [20]: tips[['date1', 'date2', 'date1_year', 'date2_month',....: 'date1_next', 'months_between']].head()....:Out[20]:date1 date2 date1_year date2_month date1_next months_between0 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>1 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>2 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>3 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>4 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
列的选择
SAS在DATA步骤中提供关键字以选择,删除和重命名列。
data tips;set tips;keep sex total_bill tip;run;data tips;set tips;drop sex;run;data tips;set tips;rename total_bill=total_bill_2;run;
下面的 Pandas 表示相同的操作。
# keepIn [21]: tips[['sex', 'total_bill', 'tip']].head()Out[21]:sex total_bill tip0 Female 14.99 1.011 Male 8.34 1.662 Male 19.01 3.503 Male 21.68 3.314 Female 22.59 3.61# dropIn [22]: tips.drop('sex', axis=1).head()Out[22]:total_bill tip smoker day time size0 14.99 1.01 No Sun Dinner 21 8.34 1.66 No Sun Dinner 32 19.01 3.50 No Sun Dinner 33 21.68 3.31 No Sun Dinner 24 22.59 3.61 No Sun Dinner 4# renameIn [23]: tips.rename(columns={'total_bill': 'total_bill_2'}).head()Out[23]:total_bill_2 tip sex smoker day time size0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 21 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 32 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
按值排序
SAS中的排序是通过 PROC SORT
proc sort data=tips;by sex total_bill;run;
pandas对象有一个sort_values()方法,它采用列表进行排序。
In [24]: tips = tips.sort_values(['sex', 'total_bill'])In [25]: tips.head()Out[25]:total_bill tip sex smoker day time size67 1.07 1.00 Female Yes Sat Dinner 192 3.75 1.00 Female Yes Fri Dinner 2111 5.25 1.00 Female No Sat Dinner 1145 6.35 1.50 Female No Thur Lunch 2135 6.51 1.25 Female No Thur Lunch 2
字符串处理
长度
SAS使用LENGTHN
和LENGTHC
函数确定字符串的长度
。LENGTHN排除尾随空白并LENGTHC包括尾随空白。
data _null_;set tips;put(LENGTHN(time));put(LENGTHC(time));run;
Python使用该len函数确定字符串的长度。
len包括尾随空白。使用len和rstrip排除尾随空格。
In [26]: tips['time'].str.len().head()Out[26]:67 692 6111 6145 5135 5Name: time, dtype: int64In [27]: tips['time'].str.rstrip().str.len().head()Out[27]:67 692 6111 6145 5135 5Name: time, dtype: int64
查找(Find)
SAS使用FINDW函数确定字符串中字符的位置
。
FINDW获取第一个参数定义的字符串,并搜索您提供的子字符串的第一个位置作为第二个参数。
data _null_;set tips;put(FINDW(sex,'ale'));run;
Python使用find函数确定字符串中字符的位置
。 find搜索子字符串的第一个位置。如果找到子字符串,则该函数返回其位置。请记住,Python索引是从零开始的,如果找不到子串,函数将返回-1。
In [28]: tips['sex'].str.find("ale").head()Out[28]:67 392 3111 3145 3135 3Name: sex, dtype: int64
字符串提取(Substring)
SAS使用SUBSTR函数根据其位置从字符串中提取子字符串 。
data _null_;set tips;put(substr(sex,1,1));run;
使用pandas,您可以使用[]符号从位置位置提取字符串中的子字符串。请记住,Python索引是从零开始的。
In [29]: tips['sex'].str[0:1].head()Out[29]:67 F92 F111 F145 F135 FName: sex, dtype: object
SCAN
SAS SCAN 函数返回字符串中的第n个字。第一个参数是要解析的字符串,第二个参数指定要提取的字。
data firstlast;input String $60.;First_Name = scan(string, 1);Last_Name = scan(string, -1);datalines2;John Smith;Jane Cook;;;;run;
Python使用正则表达式根据文本从字符串中提取子字符串。有更强大的方法,但这只是一个简单的方法。
In [30]: firstlast = pd.DataFrame({'String': ['John Smith', 'Jane Cook']})In [31]: firstlast['First_Name'] = firstlast['String'].str.split(" ", expand=True)[0]In [32]: firstlast['Last_Name'] = firstlast['String'].str.rsplit(" ", expand=True)[0]In [33]: firstlastOut[33]:String First_Name Last_Name0 John Smith John John1 Jane Cook Jane Jane
大写,小写和特殊转换
SAS UPCASE LOWCASE和 PROPCASE 函数改变了参数的大小写。
data firstlast;input String $60.;string_up = UPCASE(string);string_low = LOWCASE(string);string_prop = PROPCASE(string);datalines2;John Smith;Jane Cook;;;;run;
等效Python的功能upper,lower和title。
In [34]: firstlast = pd.DataFrame({'String': ['John Smith', 'Jane Cook']})In [35]: firstlast['string_up'] = firstlast['String'].str.upper()In [36]: firstlast['string_low'] = firstlast['String'].str.lower()In [37]: firstlast['string_prop'] = firstlast['String'].str.title()In [38]: firstlastOut[38]:String string_up string_low string_prop0 John Smith JOHN SMITH john smith John Smith1 Jane Cook JANE COOK jane cook Jane Cook
合并(Merging)
合并示例中将使用以下表格
In [39]: df1 = pd.DataFrame({'key': ['A', 'B', 'C', 'D'],....: 'value': np.random.randn(4)})....:In [40]: df1Out[40]:key value0 A 0.4691121 B -0.2828632 C -1.5090593 D -1.135632In [41]: df2 = pd.DataFrame({'key': ['B', 'D', 'D', 'E'],....: 'value': np.random.randn(4)})....:In [42]: df2Out[42]:key value0 B 1.2121121 D -0.1732152 D 0.1192093 E -1.044236
在SAS中,必须在合并之前显式排序数据。使用in=虚拟变量来跟踪是否在一个或两个输入帧中找到匹配来完成不同类型的连接。
proc sort data=df1;by key;run;proc sort data=df2;by key;run;data left_join inner_join right_join outer_join;merge df1(in=a) df2(in=b);if a and b then output inner_join;if a then output left_join;if b then output right_join;if a or b then output outer_join;run;
pandas DataFrames有一个merge()提供类似功能的方法。请注意,数据不必提前排序,并且通过how关键字可以实现不同的连接类型。
In [43]: inner_join = df1.merge(df2, on=['key'], how='inner')In [44]: inner_joinOut[44]:key value_x value_y0 B -0.282863 1.2121121 D -1.135632 -0.1732152 D -1.135632 0.119209In [45]: left_join = df1.merge(df2, on=['key'], how='left')In [46]: left_joinOut[46]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.119209In [47]: right_join = df1.merge(df2, on=['key'], how='right')In [48]: right_joinOut[48]:key value_x value_y0 B -0.282863 1.2121121 D -1.135632 -0.1732152 D -1.135632 0.1192093 E NaN -1.044236In [49]: outer_join = df1.merge(df2, on=['key'], how='outer')In [50]: outer_joinOut[50]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.1192095 E NaN -1.044236
缺失数据(Missing data)
与SAS一样,pandas具有丢失数据的表示 - 这是特殊浮点值NaN(不是数字)。许多语义都是相同的,例如,丢失的数据通过数字操作传播,默认情况下会被聚合忽略。
In [51]: outer_joinOut[51]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.1192095 E NaN -1.044236In [52]: outer_join['value_x'] + outer_join['value_y']Out[52]:0 NaN1 0.9292492 NaN3 -1.3088474 -1.0164245 NaNdtype: float64In [53]: outer_join['value_x'].sum()Out[53]: -3.5940742896293765
一个区别是丢失的数据无法与其哨兵值进行比较。例如,在SAS中,您可以执行此操作以过滤缺失值。
data outer_join_nulls;set outer_join;if value_x = .;run;data outer_join_no_nulls;set outer_join;if value_x ^= .;run;
这在 Pandas 中不起作用。相反,应使用pd.isna或pd.notna函数进行比较。
In [54]: outer_join[pd.isna(outer_join['value_x'])]Out[54]:key value_x value_y5 E NaN -1.044236In [55]: outer_join[pd.notna(outer_join['value_x'])]Out[55]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.119209
pandas还提供了各种方法来处理丢失的数据 - 其中一些方法在SAS中表达起来很有挑战性。例如,有一些方法可以删除具有任何缺失值的所有行,使用指定值替换缺失值,例如平均值或前一行的前向填充。看到 丢失的数据文件为多。
In [56]: outer_join.dropna()Out[56]:key value_x value_y1 B -0.282863 1.2121123 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.119209In [57]: outer_join.fillna(method='ffill')Out[57]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 1.2121123 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.1192095 E -1.135632 -1.044236In [58]: outer_join['value_x'].fillna(outer_join['value_x'].mean())Out[58]:0 0.4691121 -0.2828632 -1.5090593 -1.1356324 -1.1356325 -0.718815Name: value_x, dtype: float64
GroupBy
聚合(Aggregation)
SAS的PROC SUMMARY可用于按一个或多个关键变量进行分组,并计算数字列上的聚合。
proc summary data=tips nway;class sex smoker;var total_bill tip;output out=tips_summed sum=;run;
pandas提供了一种groupby允许类似聚合的灵活机制。有关
更多详细信息和示例,请参阅groupby文档。
In [59]: tips_summed = tips.groupby(['sex', 'smoker'])['total_bill', 'tip'].sum()In [60]: tips_summed.head()Out[60]:total_bill tipsex smokerFemale No 869.68 149.77Yes 527.27 96.74Male No 1725.75 302.00Yes 1217.07 183.07
转换(Transformation)
在SAS中,如果组聚合需要与原始帧一起使用,则必须将它们合并在一起。例如,减去吸烟者组每次观察的平均值。
proc summary data=tips missing nway;class smoker;var total_bill;output out=smoker_means mean(total_bill)=group_bill;run;proc sort data=tips;by smoker;run;data tips;merge tips(in=a) smoker_means(in=b);by smoker;adj_total_bill = total_bill - group_bill;if a and b;run;
pandas groupby提供了一种transform机制,允许在一个操作中简洁地表达这些类型的操作。
In [61]: gb = tips.groupby('smoker')['total_bill']In [62]: tips['adj_total_bill'] = tips['total_bill'] - gb.transform('mean')In [63]: tips.head()Out[63]:total_bill tip sex smoker day time size adj_total_bill67 1.07 1.00 Female Yes Sat Dinner 1 -17.68634492 3.75 1.00 Female Yes Fri Dinner 2 -15.006344111 5.25 1.00 Female No Sat Dinner 1 -11.938278145 6.35 1.50 Female No Thur Lunch 2 -10.838278135 6.51 1.25 Female No Thur Lunch 2 -10.678278
按组处理
除了聚合之外,groupby还可以使用pandas 通过SAS的组处理来复制大多数其他pandas 。例如,此DATA步骤按性别/吸烟者组读取数据,并过滤到每个的第一个条目。
proc sort data=tips;by sex smoker;run;data tips_first;set tips;by sex smoker;if FIRST.sex or FIRST.smoker then output;run;
在 Pandas 中,这将写成:
In [64]: tips.groupby(['sex', 'smoker']).first()Out[64]:total_bill tip day time size adj_total_billsex smokerFemale No 5.25 1.00 Sat Dinner 1 -11.938278Yes 1.07 1.00 Sat Dinner 1 -17.686344Male No 5.51 2.00 Thur Lunch 2 -11.678278Yes 5.25 5.15 Sun Dinner 2 -13.506344
其他注意事项
磁盘与内存
pandas仅在内存中运行,其中SAS数据集存在于磁盘上。这意味着可以在pandas中加载的数据大小受机器内存的限制,但对数据的操作可能更快。
如果需要进行核心处理,一种可能性是
dask.dataframe
库(目前正在开发中),它为磁盘上的pandas功能提供了一个子集DataFrame
数据互操作
pandas提供了一种read_sas()方法,可以读取以XPORT或SAS7BDAT二进制格式保存的SAS数据。
libname xportout xport 'transport-file.xpt';data xportout.tips;set tips(rename=(total_bill=tbill));* xport variable names limited to 6 characters;run;
df = pd.read_sas('transport-file.xpt')df = pd.read_sas('binary-file.sas7bdat')
您也可以直接指定文件格式。默认情况下,pandas将尝试根据其扩展名推断文件格式。
df = pd.read_sas('transport-file.xpt', format='xport')df = pd.read_sas('binary-file.sas7bdat', format='sas7bdat')
XPORT是一种相对有限的格式,它的解析并不像其他一些pandas读者那样优化。在SAS和pandas之间交换数据的另一种方法是序列化为csv。
# version 0.17, 10M rowsIn [8]: %time df = pd.read_sas('big.xpt')Wall time: 14.6 sIn [9]: %time df = pd.read_csv('big.csv')Wall time: 4.86 s
与Stata的比较
对于来自 Stata 的潜在用户,本节旨在演示如何在 pandas 中做各种类似Stata的操作。
如果您是 pandas 的新手,您可能需要先阅读十分钟入门Pandas 以熟悉本库。
按照惯例,我们按如下方式导入 pandas 和 NumPy:
In [1]: import pandas as pdIn [2]: import numpy as np
::: tip 注意
在本教程中,DataFrame将通过调用显示
pandas df.head(),它将显示该行的前N行(默认为5行)DataFrame。这通常用于交互式工作(例如Jupyter笔记本或终端) - Stata中的等价物将是:
list in 1/5
:::
数据结构
一般术语对照表
| Pandas | Stata |
|---|---|
| DataFrame | 数据集(data set) |
| column | 变量(variable) |
| row | 观察(observation) |
| groupby | bysort |
| NaN | . |
DataFrame/ Series
pandas 中的 DataFrame 类似于 Stata 数据集-具有不同类型的标记列的二维数据源。如本文档所示,几乎任何可以应用于Stata中的数据集的操作也可以在 pandas 中完成。
Series 是表示DataFrame的一列的数据结构。Stata 对于单个列没有单独的数据结构,但是通常,使用 Series 类似于引用Stata中的数据集的列。
Index
每个 DataFrame 和 Series 在数据 行 上都有一个叫 Index-label 的标签。在 Stata 中没有相似的概念。在Stata中,数据集的行基本上是无标签的,除了可以用 _n 访问的隐式整数索引。
在pandas中,如果未指定索引,则默认情况下也使用整数索引(第一行= 0,第二行= 1,依此类推)。虽然使用标记Index或
MultiIndex可以启用复杂的分析,并且最终是 pandas 理解的重要部分,但是对于这种比较,我们基本上会忽略它,
Index并且只是将其DataFrame视为列的集合。有关如何有效使用的更多信息,
请参阅索引文档Index。
数据输入/输出
从价值观构建数据帧
通过将数据放在input语句之后并指定列名,可以从指定值构建Stata数据集。
input x y1 23 45 6end
pandas 的 DataFrame 可以用许多不同的方式构建,但对于少量的值,通常可以方便地将其指定为Python字典,其中键是列名,值是数据。
In [3]: df = pd.DataFrame({'x': [1, 3, 5], 'y': [2, 4, 6]})In [4]: dfOut[4]:x y0 1 21 3 42 5 6
读取外部数据
与Stata一样,pandas提供了从多种格式读取数据的实用程序。tips在pandas测试(csv)中找到的数据集将用于以下许多示例中。
Stata提供将csv数据读入内存中的数据集。如果文件在当前工作目录中,我们可以按如下方式导入它。import delimited````tips.csv
import delimited tips.csv
pandas 方法是read_csv()类似的。此外,如果提供了网址,它将自动下载数据集。
In [5]: url = ('https://raw.github.com/pandas-dev'...: '/pandas/master/pandas/tests/data/tips.csv')...:In [6]: tips = pd.read_csv(url)In [7]: tips.head()Out[7]:total_bill tip sex smoker day time size0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 21 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 32 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
比如,可以使用许多参数来指定数据应该如何解析。例如,如果数据是由制表符分隔的,没有列名,并且存在于当前工作目录中,则pandas命令将为:import delimitedread_csv()
tips = pd.read_csv('tips.csv', sep='\t', header=None)# alternatively, read_table is an alias to read_csv with tab delimitertips = pd.read_table('tips.csv', header=None)
pandas 还可以用于 .dta 的文件格式中。使用read_stata()函数读取格式的Stata数据集。
df = pd.read_stata('data.dta')
除了text / csv和Stata文件之外,pandas还支持各种其他数据格式,如Excel,SAS,HDF5,Parquet和SQL数据库。这些都是通过pd.read_*
函数读取的。有关更多详细信息,请参阅IO文档。
导出数据
stata 中 import delimated 的反向操作是 export delimated。
export delimited tips2.csv
类似地,在 pandas 中,read_csv 的反向操作是DataFrame.to_csv()。
tips.to_csv('tips2.csv')
pandas 还可以使用DataFrame.to_stata()方法导出为Stata文件格式。
tips.to_stata('tips2.dta')
数据操作
列上的操作
在Stata中,任意数学表达式可以与新列或现有列上的generate和
replace命令一起使用。该drop命令从数据集中删除列。
replace total_bill = total_bill - 2generate new_bill = total_bill / 2drop new_bill
pandas 通过指定个体提供了类似的矢量化操作Series中DataFrame。可以以相同的方式分配新列。该DataFrame.drop()方法从中删除一列DataFrame。
In [8]: tips['total_bill'] = tips['total_bill'] - 2In [9]: tips['new_bill'] = tips['total_bill'] / 2In [10]: tips.head()Out[10]:total_bill tip sex smoker day time size new_bill0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2 7.4951 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 3 4.1702 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3 9.5053 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2 10.8404 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4 11.295In [11]: tips = tips.drop('new_bill', axis=1)
过滤
在Stata中过滤是通过 if 一个或多个列上的子句完成的。
list if total_bill > 10
DataFrame可以通过多种方式进行过滤; 最直观的是使用 布尔索引。
In [12]: tips[tips['total_bill'] > 10].head()Out[12]:total_bill tip sex smoker day time size0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 22 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 45 23.29 4.71 Male No Sun Dinner 4
如果/那么逻辑
在Stata中,if子句也可用于创建新列。
generate bucket = "low" if total_bill < 10replace bucket = "high" if total_bill >= 10
使用 numpy 的 where 方法可以在 pandas 中完成相同的操作。
In [13]: tips['bucket'] = np.where(tips['total_bill'] < 10, 'low', 'high')In [14]: tips.head()Out[14]:total_bill tip sex smoker day time size bucket0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2 high1 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 3 low2 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3 high3 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2 high4 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4 high
日期功能
Stata提供了各种函数来对date / datetime列进行操作。
generate date1 = mdy(1, 15, 2013)generate date2 = date("Feb152015", "MDY")generate date1_year = year(date1)generate date2_month = month(date2)* shift date to beginning of next monthgenerate date1_next = mdy(month(date1) + 1, 1, year(date1)) if month(date1) != 12replace date1_next = mdy(1, 1, year(date1) + 1) if month(date1) == 12generate months_between = mofd(date2) - mofd(date1)list date1 date2 date1_year date2_month date1_next months_between
等效的 pandas 操作如下所示。除了这些功能外,pandas 还支持 Stata 中不具备的其他时间序列功能(例如时区处理和自定义偏移) - 有关详细信息,请参阅时间序列文档。
In [15]: tips['date1'] = pd.Timestamp('2013-01-15')In [16]: tips['date2'] = pd.Timestamp('2015-02-15')In [17]: tips['date1_year'] = tips['date1'].dt.yearIn [18]: tips['date2_month'] = tips['date2'].dt.monthIn [19]: tips['date1_next'] = tips['date1'] + pd.offsets.MonthBegin()In [20]: tips['months_between'] = (tips['date2'].dt.to_period('M')....: - tips['date1'].dt.to_period('M'))....:In [21]: tips[['date1', 'date2', 'date1_year', 'date2_month', 'date1_next',....: 'months_between']].head()....:Out[21]:date1 date2 date1_year date2_month date1_next months_between0 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>1 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>2 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>3 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>4 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
列的选择
Stata 提供了选择,删除和重命名列的关键字。
keep sex total_bill tipdrop sexrename total_bill total_bill_2
下面的 pandas 表示相同的操作。请注意,与 Stata 相比,这些操作不会发生。要使这些更改保持不变,请将操作分配回变量。
# keepIn [22]: tips[['sex', 'total_bill', 'tip']].head()Out[22]:sex total_bill tip0 Female 14.99 1.011 Male 8.34 1.662 Male 19.01 3.503 Male 21.68 3.314 Female 22.59 3.61# dropIn [23]: tips.drop('sex', axis=1).head()Out[23]:total_bill tip smoker day time size0 14.99 1.01 No Sun Dinner 21 8.34 1.66 No Sun Dinner 32 19.01 3.50 No Sun Dinner 33 21.68 3.31 No Sun Dinner 24 22.59 3.61 No Sun Dinner 4# renameIn [24]: tips.rename(columns={'total_bill': 'total_bill_2'}).head()Out[24]:total_bill_2 tip sex smoker day time size0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 21 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 32 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 33 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 24 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
按值排序
Stata中的排序是通过 sort
sort sex total_bill
pandas 对象有一个DataFrame.sort_values()方法,它采用列表进行排序。
In [25]: tips = tips.sort_values(['sex', 'total_bill'])In [26]: tips.head()Out[26]:total_bill tip sex smoker day time size67 1.07 1.00 Female Yes Sat Dinner 192 3.75 1.00 Female Yes Fri Dinner 2111 5.25 1.00 Female No Sat Dinner 1145 6.35 1.50 Female No Thur Lunch 2135 6.51 1.25 Female No Thur Lunch 2
字符串处理
查找字符串的长度
Stata 分别使用ASCII和Unicode字符串 strlen() 和 ustrlen() 函数确定字符串的长度。
generate strlen_time = strlen(time)generate ustrlen_time = ustrlen(time)
Python 使用该 len 函数确定字符串的长度。在Python 3中,所有字符串都是Unicode字符串。len包括尾随空白。使用len和rstrip排除尾随空格。
In [27]: tips['time'].str.len().head()Out[27]:67 692 6111 6145 5135 5Name: time, dtype: int64In [28]: tips['time'].str.rstrip().str.len().head()Out[28]:67 692 6111 6145 5135 5Name: time, dtype: int64
找到字符串的位置
Stata使用该strpos()函数确定字符串中字符的位置。这将获取第一个参数定义的字符串,并搜索您提供的子字符串的第一个位置作为第二个参数。
generate str_position = strpos(sex, "ale")
Python使用find()函数确定字符串中字符的位置。find搜索子字符串的第一个位置。如果找到子字符串,则该函数返回其位置。请记住,Python索引是从零开始的,如果找不到子串,函数将返回-1。
In [29]: tips['sex'].str.find("ale").head()Out[29]:67 392 3111 3145 3135 3Name: sex, dtype: int64
按位置提取字符串
Stata根据substr()函数的位置从字符串中提取字符串。
generate short_sex = substr(sex, 1, 1)
使用pandas,您可以使用[]符号从位置位置提取字符串中的子字符串。请记住,Python索引是从零开始的。
In [30]: tips['sex'].str[0:1].head()Out[30]:67 F92 F111 F145 F135 FName: sex, dtype: object
提取第n个字符
Stata word()函数返回字符串中的第n个单词。第一个参数是要解析的字符串,第二个参数指定要提取的字。
clearinput str20 string"John Smith""Jane Cook"endgenerate first_name = word(name, 1)generate last_name = word(name, -1)
Python使用正则表达式根据文本从字符串中提取字符串。有更强大的方法,但这只是一个简单的方法。
In [31]: firstlast = pd.DataFrame({'string': ['John Smith', 'Jane Cook']})In [32]: firstlast['First_Name'] = firstlast['string'].str.split(" ", expand=True)[0]In [33]: firstlast['Last_Name'] = firstlast['string'].str.rsplit(" ", expand=True)[0]In [34]: firstlastOut[34]:string First_Name Last_Name0 John Smith John John1 Jane Cook Jane Jane
改变案例
所述的Stata strupper(),strlower(),strproper(),
ustrupper(),ustrlower(),和ustrtitle()功能分别改变ASCII和Unicode字符串的情况下,。
clearinput str20 string"John Smith""Jane Cook"endgenerate upper = strupper(string)generate lower = strlower(string)generate title = strproper(string)list
等效Python的功能upper,lower和title。
In [35]: firstlast = pd.DataFrame({'string': ['John Smith', 'Jane Cook']})In [36]: firstlast['upper'] = firstlast['string'].str.upper()In [37]: firstlast['lower'] = firstlast['string'].str.lower()In [38]: firstlast['title'] = firstlast['string'].str.title()In [39]: firstlastOut[39]:string upper lower title0 John Smith JOHN SMITH john smith John Smith1 Jane Cook JANE COOK jane cook Jane Cook
合并
合并示例中将使用以下表格
In [40]: df1 = pd.DataFrame({'key': ['A', 'B', 'C', 'D'],....: 'value': np.random.randn(4)})....:In [41]: df1Out[41]:key value0 A 0.4691121 B -0.2828632 C -1.5090593 D -1.135632In [42]: df2 = pd.DataFrame({'key': ['B', 'D', 'D', 'E'],....: 'value': np.random.randn(4)})....:In [43]: df2Out[43]:key value0 B 1.2121121 D -0.1732152 D 0.1192093 E -1.044236
在Stata中,要执行合并,一个数据集必须在内存中,另一个必须作为磁盘上的文件名引用。相比之下,Python必须DataFrames已经在内存中。
默认情况下,Stata执行外部联接,其中两个数据集的所有观察值在合并后都保留在内存中。通过使用在_merge变量中创建的值,可以仅保留来自初始数据集,合并数据集或两者的交集的观察
。
* First create df2 and save to diskclearinput str1 keyBDDEendgenerate value = rnormal()save df2.dta* Now create df1 in memoryclearinput str1 keyABCDendgenerate value = rnormal()preserve* Left joinmerge 1:n key using df2.dtakeep if _merge == 1* Right joinrestore, preservemerge 1:n key using df2.dtakeep if _merge == 2* Inner joinrestore, preservemerge 1:n key using df2.dtakeep if _merge == 3* Outer joinrestoremerge 1:n key using df2.dta
pandas 的 DataFrames 有一个DataFrame.merge()提供类似功能的方法。请注意,通过how关键字可以实现不同的连接类型。
In [44]: inner_join = df1.merge(df2, on=['key'], how='inner')In [45]: inner_joinOut[45]:key value_x value_y0 B -0.282863 1.2121121 D -1.135632 -0.1732152 D -1.135632 0.119209In [46]: left_join = df1.merge(df2, on=['key'], how='left')In [47]: left_joinOut[47]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.119209In [48]: right_join = df1.merge(df2, on=['key'], how='right')In [49]: right_joinOut[49]:key value_x value_y0 B -0.282863 1.2121121 D -1.135632 -0.1732152 D -1.135632 0.1192093 E NaN -1.044236In [50]: outer_join = df1.merge(df2, on=['key'], how='outer')In [51]: outer_joinOut[51]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.1192095 E NaN -1.044236
缺少数据
像Stata一样,pandas 有缺失数据的表示 - 特殊浮点值NaN(不是数字)。许多语义都是一样的; 例如,丢失的数据通过数字操作传播,默认情况下会被聚合忽略。
In [52]: outer_joinOut[52]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.1192095 E NaN -1.044236In [53]: outer_join['value_x'] + outer_join['value_y']Out[53]:0 NaN1 0.9292492 NaN3 -1.3088474 -1.0164245 NaNdtype: float64In [54]: outer_join['value_x'].sum()Out[54]: -3.5940742896293765
一个区别是丢失的数据无法与其哨兵值进行比较。例如,在 Stata 中,您可以执行此操作以过滤缺失值。
* Keep missing valueslist if value_x == .* Keep non-missing valueslist if value_x != .
这在 pandas 中不起作用。相反,应使用pd.isna()或pd.notna()函数进行比较。
In [55]: outer_join[pd.isna(outer_join['value_x'])]Out[55]:key value_x value_y5 E NaN -1.044236In [56]: outer_join[pd.notna(outer_join['value_x'])]Out[56]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 NaN3 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.119209
pandas 还提供了多种处理丢失数据的方法,其中一些方法在Stata中表达起来很有挑战性。例如,有一些方法可以删除具有任何缺失值的所有行,用指定值(如平均值)替换缺失值,或从前一行向前填充。有关详细信息,请参阅缺失数据文档。
# Drop rows with any missing valueIn [57]: outer_join.dropna()Out[57]:key value_x value_y1 B -0.282863 1.2121123 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.119209# Fill forwardsIn [58]: outer_join.fillna(method='ffill')Out[58]:key value_x value_y0 A 0.469112 NaN1 B -0.282863 1.2121122 C -1.509059 1.2121123 D -1.135632 -0.1732154 D -1.135632 0.1192095 E -1.135632 -1.044236# Impute missing values with the meanIn [59]: outer_join['value_x'].fillna(outer_join['value_x'].mean())Out[59]:0 0.4691121 -0.2828632 -1.5090593 -1.1356324 -1.1356325 -0.718815Name: value_x, dtype: float64
的GroupBy
聚合
Stata collapse可用于按一个或多个关键变量进行分组,并计算数字列上的聚合。
collapse (sum) total_bill tip, by(sex smoker)
pandas提供了一种groupby允许类似聚合的灵活机制。有关
更多详细信息和示例,请参阅groupby文档。
In [60]: tips_summed = tips.groupby(['sex', 'smoker'])['total_bill', 'tip'].sum()In [61]: tips_summed.head()Out[61]:total_bill tipsex smokerFemale No 869.68 149.77Yes 527.27 96.74Male No 1725.75 302.00Yes 1217.07 183.07
转换
在Stata中,如果组聚合需要与原始数据集一起使用bysort,通常会使用egen()。例如,减去吸烟者组每次观察的平均值。
bysort sex smoker: egen group_bill = mean(total_bill)generate adj_total_bill = total_bill - group_bill
pandas groupby提供了一种transform机制,允许在一个操作中简洁地表达这些类型的操作。
In [62]: gb = tips.groupby('smoker')['total_bill']In [63]: tips['adj_total_bill'] = tips['total_bill'] - gb.transform('mean')In [64]: tips.head()Out[64]:total_bill tip sex smoker day time size adj_total_bill67 1.07 1.00 Female Yes Sat Dinner 1 -17.68634492 3.75 1.00 Female Yes Fri Dinner 2 -15.006344111 5.25 1.00 Female No Sat Dinner 1 -11.938278145 6.35 1.50 Female No Thur Lunch 2 -10.838278135 6.51 1.25 Female No Thur Lunch 2 -10.678278
按组处理
除聚合外,pandas groupby还可用于复制bysortStata中的大多数其他处理。例如,以下示例按性别/吸烟者组列出当前排序顺序中的第一个观察结果。
bysort sex smoker: list if _n == 1
在 pandas 中,这将写成:
In [65]: tips.groupby(['sex', 'smoker']).first()Out[65]:total_bill tip day time size adj_total_billsex smokerFemale No 5.25 1.00 Sat Dinner 1 -11.938278Yes 1.07 1.00 Sat Dinner 1 -17.686344Male No 5.51 2.00 Thur Lunch 2 -11.678278Yes 5.25 5.15 Sun Dinner 2 -13.506344
其他注意事项
磁盘与内存
pandas 和 Stata 都只在内存中运行。这意味着能够在 pandas 中加载的数据大小受机器内存的限制。如果需要进行核心处理,则有一种可能性是dask.dataframe 库,它为磁盘上的pandas功能提供了一个子集DataFrame。
