2020年11月27日

学习资源：生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)

了解常量和变量概念

加减乘除等运算（计算器）

多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子）

多种数据结构（向量，矩阵，数组，数据框，列表）

数组、数据框、列表

  1. 数组每个元素的类型都是一样的
  2. 数据框每一列的数据类型一样，但长度需要一样
  3. 列表数据类型可以不一样，长度也可以不同

文件读取和写出

简单统计可视化

数据的三种类型

  1. 分类数据，又名定性数据或者品质数据。
  2. 顺序数据。它其实是是分类数据的一种
  3. 数值型数据，又名定量数据，这个才是重点。又可以分成离散型和连续型

定量数据的集中趋势指标主要

众数、分位数和平均数。

定量数据的离散趋势指标主要

极差，方差和标准差，标准分数，相对离散系数（变异系数），偏态系数与峰态系数。

简单统计函数：

  1. mean,sd,mad,cv,max,min,median
  2. 绘图代码
    • dev.new()新建画板
    • plot()绘制点线图,条形图,散点图.
    • barplot( ) 绘制条形图
    • dotchart( ) 绘制点图
    • pie( )绘制饼图.
    • pair( )绘制散点图阵
    • boxplot( )绘制箱线图
    • hist( )绘制直方图
    • scatterplot3D( )绘制3D散点图.
    • 低级绘图函数:
      • par()　可以添加很多参数来修改图形
      • title( )　添加标题
      • axis( )　调整刻度
      • rug( )　添加轴密度
      • grid( )　添加网格线
      • abline( )　添加直线
      • lines( )　添加曲线
      • text( )　添加标签
      • legend()　添加图例
  3. ggplot的绘图

学习资源

  1. 30道练习题带你玩转统计学的R语言版
  2. 生物统计第一弹之统计基础概念
  3. 基于R的可视化习题30个

数据对象的高级操作

普通数据（向量，数据框，数组，列表）的高级操作，主要是apply家族函数，以及aggregate，merge, split，by 等函数的用法。这是一个分水岭，用好了你就才可能是R入门了。也可以用一些包，比如reshape2，dplyr，可以做数据的高级操作。

无限量函数学习

技巧

  1. 用项目的方式管理你的代码！
  2. 用Rdata文件来保存和加载（save和load）变量，类似于Excel表格软件才能打开的xlxs后缀文件。
  3. 善用tab键补全。