参考:B站视频 用Cytoscape绘制网络图

从网络导入网络图

本次演示从网络直接导入图,之前的教程Cytoscape作图教程-cytoscape网络文件制作及导入是从通过string制作file导入。本次直接输入想要了解的基因,绘制网络图
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可以选择多个数据库,然后可点击automatic network merge即可。

节点和边的参数设置

cytoscape节点和边参数的设置-生信宝典.png

批量选中修改删除某些节点

可在右下方nodes,edges里按照自己的要求批量选择nodes或edges,再在展示图片框内右击-选择想要的操作。
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设置边

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修改字体或边节点的透明度


cytoscape调节线的透明度.png

修改节点的显示名称,选择image可以节点加上图像

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cytoscape样式调节1.png
cytoscape修改后导出方法2.png