参考:生信宝典及宏基因组 用cytoscape绘制网络图

1.cytoscape支持并识别多种格式:txt,excel

2.互作网络数据文件至少包括两列:源节点和靶节点。建议加上互作关系的类型

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3.属性数据文件,用来设置节点的显示方式

节点名称要和构建网络数据中的一致,expression是属性的一种,可以根据需要自行增加属性
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4 导入网络数据,先导入网络文件再导入属性文件

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导入后出现
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5导入属性文件

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6.设置:style-nodes/edges-def./map.,选择network可更改画布背景
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7 安装app插件,从kegg里面导入数据
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其属性文件需要自己再制作,如下图
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导入的时候要设置好key column,要跟网络文件的source nodes 一致。

8.导出legend

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9 bingo的使用

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