参考:生信宝典及宏基因组 用cytoscape绘制网络图
1.cytoscape支持并识别多种格式:txt,excel
2.互作网络数据文件至少包括两列:源节点和靶节点。建议加上互作关系的类型
3.属性数据文件,用来设置节点的显示方式
节点名称要和构建网络数据中的一致,expression是属性的一种,可以根据需要自行增加属性
4 导入网络数据,先导入网络文件再导入属性文件
5导入属性文件
6.设置:style-nodes/edges-def./map.,选择network可更改画布背景
7 安装app插件,从kegg里面导入数据
其属性文件需要自己再制作,如下图
导入的时候要设置好key column,要跟网络文件的source nodes 一致。