1.plot() 绘制散点图等多种图形,根据数据的类型,调用相应的函数绘图。hist()频率直方图,boxplot()箱线图,stripchart()点图,barplot()柱状图,dotplot()点图,piechart()饼图,matplot()数字图形。
2.lines()添加线,curve()添加曲线,abline()添加给丁斜率的线,points()添加点,segments()添加折线,arrows()箭头,axis()坐标轴,box()外框,title标题,text()文字,mtext()图边文字。
3.映射:领导思维,只说按照某列分配颜色,不必说具体哪几种颜色。手动设置:把所有的点设置为同一个颜色,直接指定是那个颜色。
4.作图最重要的是数据清洗,即数据结构、数据类型、行、列的组织方式、对应关系、缺失值、异常值。
5.mutate:新增列,select()、filter()筛选列、行,%>%管道符号省去了一直赋值的过程。
- 读取表达矩阵
eSet <- read.table("GSE169130_gene_sample_FPKM_with_symbol.txt.gz",
header = T,
sep = "\t",
quote = "",
fill = T)