ONNX(Open Neural Network Exchange,开放神经网络交换)是为人工智能模型(深度学习和传统ML)提供的一种开放格式,可使模型在不同框架之间进行转移。详见 https://github.com/onnx/onnx
Alink提供了OnnxModelPredictBatchOp、OnnxModelPredictStreamOp和�OnnxModelPredictor组件,分别处理批式场景、流式场景和进行Pipeline封装。
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各组件都需要指定 ONNX 模型的modelPath
模型路径参数。模型路径可以是以下形式:
- 本地文件:
file://
加绝对路径,例如file:///tmp/dnn.py
; - Java 包中的资源文件:
res://
加路径,例如res:///dnn.py
; - http/https 文件:
http://
或https://
路径; - OSS 文件:
oss://
加路径和 Endpoint 和 access key
等信息,例如oss://bucket/xxx/xxx/xxx.py?host=xxx&access_key_id=xxx&access_key_secret=xxx
; - HDFS 文件:
hdfs://
加路径;
参与模型预测的数据通过参数 selectedCols
设置,需要注意以下几点:
- ONNX 模型使用 input name 来标识模型输入桩的,因此需要设置
inputNames
,与selectedCols
一一对应,表明某列对应某输入桩。inputNames
不填写时,默认与列名一致。 - 仅支持输入桩为
Tensor
类型,不支持Sequences
和Maps
类型。 - 所选择的列的类型需要是
float, double, int, long, byte, string
类型及其对应的 AlinkTensor
类型。
模型输出信息通过参数 outputSchemaStr
指定,包括输出列名以及名称,需要注意以下几点:
- ONNX 模型使用 output name 来标识模型输出桩的,因此需要设置
outputNames
,与outputSchemaStr
一一对应,表明某列对应某输入桩。outputNames
不填写时,默认与列名一致。 - 仅支持输出桩为
Tensor
类型,不支持Sequences
和Maps
类型。 outputSchemaStr
填写的输出类型需要是对应的输出桩类型,例如 输出桩类型 为 Float 类型的 Tensor 时,对应的 Alink 类型可以是TENSOR
或者FLOAT_TENSOR
,当输出仅包含一个元素时,还可以是FLOAT
。
组件使用的是 ONNX 1.11.0 版本,当有 GPU 时,自动使用 GPU 进行推理,否则使用 CPU 进行推理。
25.7.1 批式任务中使用ONNX模型
使用OnnxModelPredictBatchOp组件,可以加载ONNX模型进行批式预测。关于该组件的详细说明参见Alink文档 https://www.yuque.com/pinshu/alink_doc/onnxmodelpredictbatchop .
使用ONNX模型前,还需要将输入数据列的类型转换为Tensor格式,可以使用VectorToTensorBatchOp组件。具体代码如下所示:
new AkSourceBatchOp()
.setFilePath(Chap13.DATA_DIR + Chap13.DENSE_TEST_FILE)
.link(
new VectorToTensorBatchOp()
.setTensorDataType("float")
.setTensorShape(1, 1, 28, 28)
.setSelectedCol("vec")
.setOutputCol("tensor")
.setReservedCols("label")
)
.link(
new OnnxModelPredictBatchOp()
.setModelPath(
"https://alink-release.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/data-files/cnn_mnist_pytorch.onnx")
.setSelectedCols("tensor")
.setInputNames("0")
.setOutputNames("21")
.setOutputSchemaStr("probabilities FLOAT_TENSOR")
)
.link(
new UDFBatchOp()
.setFunc(new GetMaxIndex())
.setSelectedCols("probabilities")
.setOutputCol("pred")
)
.lazyPrint(3)
.link(
new EvalMultiClassBatchOp()
.setLabelCol("label")
.setPredictionCol("pred")
.lazyPrintMetrics()
);
BatchOperator.execute();
这里用到了一个自定义函数,具体定义如下:
public static class GetMaxIndex extends ScalarFunction {
public int eval(FloatTensor tensor) {
int k = 0;
float max = tensor.getFloat(0, 0);
for (int i = 1; i < 10; i++) {
if (tensor.getFloat(0, i) > max) {
k = i;
max = tensor.getFloat(0, i);
}
}
return k;
}
}
批式任务的运行结果为:
label|tensor|probabilities|pred
-----|------|-------------|----
0|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |0
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[0.0 -1434.9991 -1350.7235 ... -1287.3451 -1404.4778 -1434.9991]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
9|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |9
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1105.8378 -1105.8378 -1105.8378 ... -1105.8378 -732.2857 0.0]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
1|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |1
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1503.7417 0.0 -1402.91 ... -1180.878 -1370.2913 -1503.7417]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
-------------------------------- Metrics: --------------------------------
Accuracy:0.9904 Macro F1:0.9904 Micro F1:0.9904 Kappa:0.9893
|Pred\Real| 9| 8| 7|...| 2| 1| 0|
|---------|---|---|----|---|----|----|---|
| 9|988| 3| 3|...| 0| 0| 0|
| 8| 1|962| 0|...| 1| 0| 1|
| 7| 6| 2|1014|...| 3| 0| 1|
| ...|...|...| ...|...| ...| ...|...|
| 2| 0| 2| 3|...|1021| 0| 0|
| 1| 3| 0| 6|...| 3|1134| 0|
| 0| 2| 4| 0|...| 1| 0|978|
25.7.2 流式任务中使用ONNX模型
使用OnnxModelPredictStreamOp组件,可以加载ONNX模型进行批式预测。关于该组件的详细说明参见Alink文档 https://www.yuque.com/pinshu/alink_doc/onnxmodelpredictstreamop .
使用ONNX模型前,还需要将输入数据列的类型转换为Tensor格式,可以使用VectorToTensorStreamOp组件。具体代码如下所示:
new AkSourceStreamOp()
.setFilePath(Chap13.DATA_DIR + Chap13.DENSE_TEST_FILE)
.link(
new VectorToTensorStreamOp()
.setTensorDataType("float")
.setTensorShape(1, 1, 28, 28)
.setSelectedCol("vec")
.setOutputCol("tensor")
.setReservedCols("label")
)
.link(
new OnnxModelPredictStreamOp()
.setModelPath("https://alink-release.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/data-files/cnn_mnist_pytorch"
+ ".onnx")
.setSelectedCols("tensor")
.setInputNames("0")
.setOutputNames("21")
.setOutputSchemaStr("probabilities FLOAT_TENSOR")
)
.link(
new UDFStreamOp()
.setFunc(new GetMaxIndex())
.setSelectedCols("probabilities")
.setOutputCol("pred")
)
.sample(0.001)
.print();
StreamOperator.execute();
运行结果为:
label|tensor|probabilities|pred
-----|------|-------------|----
5|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |5
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1679.8259 -1679.8259 -1679.8259 ... -1679.8259 -1399.0499 -1008.8595]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
8|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |8
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-565.4354 -879.83417 -691.5988 ... -898.3416 0.0 -784.97516]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
7|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |7
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1642.872 -1219.6741 -818.6717 ... 0.0 -1427.4896 -1179.5854]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
......
25.7.3 Pipeline中使用ONNX模型
学习了如何在批式任务和流式任务中使用ONNX模型,我们很容易在Pipeline中使用ONNX模型进行预测,只要将其中的批式/流式组件对应到Pipeline组件即可。具体代码如下:
new PipelineModel(
new VectorToTensor()
.setTensorDataType("float")
.setTensorShape(1, 1, 28, 28)
.setSelectedCol("vec")
.setOutputCol("tensor")
.setReservedCols("label"),
new OnnxModelPredictor()
.setModelPath("https://alink-release.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/data-files/cnn_mnist_pytorch.onnx")
.setSelectedCols("tensor")
.setInputNames("0")
.setOutputNames("21")
.setOutputSchemaStr("probabilities FLOAT_TENSOR")
).save(Chap13.DATA_DIR + PIPELINE_ONNX_MODEL, true);
BatchOperator.execute();
PipelineModel
.load(Chap13.DATA_DIR + PIPELINE_ONNX_MODEL)
.transform(
new AkSourceStreamOp()
.setFilePath(Chap13.DATA_DIR + Chap13.DENSE_TEST_FILE)
)
.link(
new UDFStreamOp()
.setFunc(new GetMaxIndex())
.setSelectedCols("probabilities")
.setOutputCol("pred")
)
.sample(0.001)
.print();
StreamOperator.execute();
运行结果为:
label|tensor|probabilities|pred
-----|------|-------------|----
6|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |6
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1234.3433 -1670.8674 -1670.8674 ... -1670.8674 -1384.003 -1670.8674]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
7|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |7
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-615.27924 -152.31528 -290.78244 ... 0.0 -575.1346 -499.75998]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
1|FloatTensor(1,1,28,28) |FloatTensor(1,10) |1
|[[[[0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|[[-1557.5773 0.0 -1557.5773 ... -1363.7996 -1293.8707 -1557.5773]]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... |
| [0.0 0.0 0.0 ... 0.0 0.0 0.0]|
| ... ... |
......
25.7.4 LocalPredictor中使用ONNX模型
除了通过Alink任务使用ONNX模型,也可以使用LocalPredictor进行嵌入式预测。示例代码如下,首先从数据集中抽取一行数据,输入数据的SchemaStr为“vec string, label int”;然后通过导入上一节保存的Pipeline模型,并设置输入数据的SchemaStr,得到LocalPredictor类型的实例localPredictor;如果不确定预测结果各列的含义,可以打印输出localPredictor的OutputSchema;使用localPredictor的map方法获得预测结果。
AkSourceBatchOp source = new AkSourceBatchOp()
.setFilePath(Chap13.DATA_DIR + Chap13.DENSE_TEST_FILE);
System.out.println(source.getSchema());
Row row = source.firstN(1).collect().get(0);
LocalPredictor localPredictor
= new LocalPredictor(Chap13.DATA_DIR + PIPELINE_ONNX_MODEL, "vec string, label int");
System.out.println(localPredictor.getOutputSchema());
Row r = localPredictor.map(row);
System.out.println(r.getField(0).toString() + " | " + r.getField(2).toString());
localPredictor.close();
运行结果为:
root
|-- vec: STRING
|-- label: INT
root
|-- label: INT
|-- tensor: LEGACY(GenericType<com.alibaba.alink.common.linalg.tensor.FloatTensor>)
|-- probabilities: LEGACY(GenericType<com.alibaba.alink.common.linalg.tensor.FloatTensor>)
1 | FloatTensor(1,10)
[[-1503.7417 0.0 -1402.91 ... -1180.878 -1370.2913 -1503.7417]]