BiocManager::install()报错

错误示例：

  1. > BiocManager::install("sva")
  2. 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see '?repositories' for details
  4. replacement repositories:
  5.     CRAN: https://cran.rstudio.com/
  7. Bioconductor version 3.12 (BiocManager 1.30.13), R 4.0.5 (2021-03-31)
  8. Installing package(s) 'BiocVersion', 'sva'
  9. also installing the dependency ‘genefilter’
  11. Error in readRDS(dest) : error reading from connection

错误原因： BiocManager 包自身存在的bug，可以使用其他开发版本的代替
解决方案：

  1. install.packages("devtools")   # unnecessary if you have it already
  2. devtools::install_github("Bioconductor/BiocManager", ref="ghost-binary-repo")

安装后重新启动R

注意：该方法目前是可以用的，后续是否可以使用未知