Flag interpreter and calculator: https://broadinstitute.github.io/picard/explain-flags.html

    记得住么？！随便看看！差不多得了！

    讲道理flagstat出来的结果是要会算的。注意双端和单端在unique和secondary计算的区别。

    单端经常用的就

    1. samtools view -@24 -bh -F0X100 ${bam}
    2. samtools flagstat -@24 ${bam}