根据day2的代码,参照day2视频完成day2的内容,内容包括:根据之前CIBERSORT的结果,结合生存文件使用最佳cutoff筛选预后良好的免疫细胞,构建bootstrap的多因素COX的TME-浸润score(注意cox的风险值越低——说明预后良好的免疫细胞浸润多——TME浸润score高),并绘制生存曲线,高TME-浸润score预后好(保护因素多),作GPR和TME的相关性热图,并根据中位值划分GPR-score和TME-score,分为4组,目标是使四组的生存尽可能分开。例如胃癌的结果是GPRhigh+TME-low预后最差,GPRlow+TME-high的预后最好。
