会议要点

1.pretrain的方式要有正例和负例，不能只mask modification site，对于non modification 的位点也要考虑
2.对于Ground truth里没有的，我们在label里是0，对于这种建议做two stage, 即一个loss来对0的位置做二元监督，另外一个loss做intensity数值上的监督。其中，对于可能不是0的部分，对于二元监督的loss的weight可以放低。
3.确认一下prosit算Pearson correlation 的方式，确认是否是全部的pair都算进去，而不是仅仅算ground truth里有的

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1.Two stage的ion intensity的预测，两个loss，一个loss来对0的位置做二元监督，另外一个loss做intensity数值上的监督。
2.在prosit上pretrain，然后在我们的model上fine tune
3.尝试使用transformer 对intensity进行预测