fastqc结果查看

html文件则为结果展示文件，zip文件储存了结果以及图片，下载查看

2-1 fastqc结果（可以通过shell脚本批量比对，也可以把文件都跟在后面）

序列的基本信息

（2）每一个碱基的质量分布情况，一般分布在绿色区域（大于Q30）较好黄色（大于Q20），红色区域质量较差

（3）每一条序列的质量情况，纵轴为reads数，横轴为质量，大多分布在Q30以上

（4）每条序列的GC含量、AT含量，好的结果为A=T以及G=C（如下图）

（4）每条序列的GC含量百分比，蓝色为经验值，红色为样品，符合经验值的分布（如下图）

（5）N碱基的数量

（6）序列长度的分布

（6）重复序列的占比

（6）是否有大量重复的序列

（7）测序接头情况，存在接头（下下图为不存在接头）