1. 问题
    2. 当一个工具在多个文件中产生输出时，我该怎么做?
    3. 我如何指定哪些输出文件应该被保存?
    4. 目标
    5. 学习如何创建输出文件数组。

    您还可以使用glob将多个输出文件捕获到文件数组中。
    array-outputs.cwl

    1. #!/usr/bin/env cwl-runner
    3. cwlVersion: v1.0
    4. class: CommandLineTool
    5. baseCommand: touch
    6. inputs:
    7.   touchfiles:
    8.     type:
    9.       type: array
    10.       items: string
    11.     inputBinding:
    12.       position: 1
    13. outputs:
    14.   output:
    15.     type:
    16.       type: array
    17.       items: File
    18.     outputBinding:
    19.       glob: "*.txt"

    array-outputs-job.yml

    1. touchfiles:
    2.   - foo.txt
    3.   - bar.dat
    4.   - baz.txt

    现在调用cwl-runner

    1. $ cwl-runner array-outputs.cwl array-outputs-job.yml
    2. [job 140190876078160] /home/example$ touch foo.txt bar.dat baz.txt
    3. Final process status is success
    4. {
    5.   "output": [
    6.     {
    7.       "size": 0,
    8.       "location": "foo.txt",
    9.       "checksum": "sha1$da39a3ee5e6b4b0d3255bfef95601890afd80709",
    10.       "class": "File"
    11.     },
    12.     {
    13.       "size": 0,
    14.       "location": "baz.txt",
    15.       "checksum": "sha1$da39a3ee5e6b4b0d3255bfef95601890afd80709",
    16.       "class": "File"
    17.     }
    18.   ]
    19. }

    正如YAML指南中所描述的，预期输出的数组在array-outputs-job中指定。yml每个条目用一个前导符号-标记。也可以在CWL描述中使用这种格式来标记数组中的条目，如下面的几个部分所示。