利用powermarker分析群体遗传数据-SSR标记
首先是将系统时间改成2010年之前,因为软件已经不再更新,改了系统时间才能使用。
- SSR数据的格式,参考让剑给的标记格式,位点的2个数值之间用斜杠分割,数据的第一列line,是样品名称,其他列是markers;
- File新建new时选择clipboard导入原始数据,之后设置category等信息,可以参考中文说明材料;
- 然后开始统计分析,选择analysis中的frequency satastise,即可统计出所有的参数
4、分析群体遗传距离
第一步先分析phylogeny,是必须的,只有这一步完成了才能开始下一步的分析
然后第二步分析
Frequency based distance,其中很多参数可以选,一般选Nei‘s