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三大高级分析

浏览 121 扫码 分享 2023-11-26 10:33:14
  • 1.拟时序分析
  • 2.转录因子分析
  • 3.细胞通讯分析

    1.拟时序分析

    2.转录因子分析

    3.细胞通讯分析

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    • 一些笔记
    • 三大高级分析
    • 复习seurat标准流程
    • Q1：多个单细胞亚群合并
    • Q2：提取单细胞亚群子集
    • Q3：怎样的分群是合理的
    • Q4：细胞亚群等比例抽样
    • Q5：高级版本的多个单细胞亚群的多个标记基因可视化
    • Q6：任意单细胞亚群差异分析
    • 任意文献的单细胞亚群标记基因
    • 单细胞亚群的生物学合理命名讨论
    • 多个单细胞亚群各自标记基因联合进行GO和KEGG
    • 差异分析后的GO和KEGG
    • 差异分析后的GSEA
    • 运行inferCNV对单细胞转录组找拷贝数变异
    • 理解inferCNV结果文件
    • 拟时序分析
    • 拟时序分析之其他方法
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      • 细胞通讯分析背景知识
      • 细胞通讯分析
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