2022.4.5 笔记进度终于赶上了，于4.6.14:06写下的！！！

基础知识

数据框排序

这里用到sort()和order()，与取子集的知识；这里默认升序，若要讲叙， decreasing = T（两个都是）
arrange()也可以，tidyverse让代码更易读，不过这里的降序是desc（）

  1. # order 可以给向量排序，也可以给数据框排序
  2. sort(test$Sepal.Length)
  3. test$Sepal.Length[order(test$Sepal.Length)]
  5. test[order(test$Sepal.Length),]
  6. test[order(test$Sepal.Length,decreasing = T),]
  8. # arrange，更加灵活的排序
  10. library(dplyr)
  11. arrange(test, Sepal.Length)
  12. arrange(test, desc(Sepal.Length))
  13. arrange(test, desc(Sepal.Width),Sepal.Length)

表达矩阵绘制箱型图

ggplot2()不识别行名，所以需要把行名转化为第一列：rownames_to_column()
转置的是矩阵，所以后面需要as.data.frame()
总的来说，这里需要宽变长，用到了pivot_longer()函数——新合并的列名，这一步还挺难的，得看例子才明白
image.png

连接 其实就是inner_join及其变体 以及merge()

这里指的注意的是，对于缺失值，存在全连接，半连接，反连接；以及位置的左右连接。

字符串函数

这部分昨天上课的时候，我的表现确实不好，但是没怎么理解到位啊
image.png
str_split()分出的是一个列表list，所以查看里面的元素是[[1]]，双括号；以及这里的simplify = T

simplify If FALSE, the default, returns a list of character vectors. If TRUE returns a character matrix.

image.png

  1. ###3.按位置提取字符串
  2. str_sub(x,5,9)
  4. ###4.字符检测
  5. str_detect(x2,"h")
  6. #这里返回了等长的逻辑值向量，可以用来取子集
  8. ###5.字符串替换
  9. str_replace(x2,"o","A") #只会替换掉一个，下面是全部替换
  10. str_replace_all(x2,"o","A")
  12. ###6.字符删除
  13. str_remove(x," ") #同上
  14. str_remove_all(x," ")

条件语句与循环语句

  1. if(){ }

(1)只有if没有else，那么条件是FALSE时就什么都不做
if后面的括号里不支持向量；支持“T” or “F”
(2)有else ：只有三个参数，第一个是生成逻辑值向量的代码，后面分别是T或F的返回值
参考如下（方便后面复制）

  1. #### (3)多个条件
  2. i = 0
  3. if (i>0){
  4.   print('+')
  5. } else if (i==0) {
  6.   print('0')
  7. } else if (i< 0){
  8.   print('-')
  9. }
  11. ifelse(i>0,"+",ifelse(i<0,"-","0"))
  1. 循环语句

两种循环方式：image.pngimage.png
因为生成的列表；do.call()是批量操作的意思，cbind是对后面的result按列拼接；前面do.call进行批量操作了。
毕竟这里没有simplify = T 的参数了
（我觉得这个先看懂吧，离会用还是太远了）

知识补充

  1. 补充三个来自dplyr的函数

image.png（需要赋值！！）image.png（这个我还是挺经常见的）image.png管道符的应用

  1. 长脚本的管理方式image.pngimage.png

截图与代码来源于生信技能树全程班中R基础班课程PPT