统计比对到每个piRNA上的counts,作为piRNA的原始表达值,并使用DESeq2 R包进行标准化。

    piRNAid sequence A1 (raw) B3 (raw) A1 (norm) B3 (norm)
    hsa_piR_000004 AACACA…GAG 1 6 2.92 4.42

    表5. piRNA表达谱

    各列说明:
    piRNA:piRNA名字,带novel的为新预测的piRNA
    sequence:piRNA序列
    *(raw):每个piRNA在每个样品中的原始read counts
    *(norm):每个piRNA在每个样品中的标准化read counts