统计比对到每个piRNA上的counts,作为piRNA的原始表达值,并使用DESeq2 R包进行标准化。
piRNAid | sequence | A1 (raw) | … | B3 (raw) | A1 (norm) | … | B3 (norm) |
---|---|---|---|---|---|---|---|
hsa_piR_000004 | AACACA…GAG | 1 | … | 6 | 2.92 | … | 4.42 |
表5. piRNA表达谱
各列说明:
piRNA:piRNA名字,带novel的为新预测的piRNA
sequence:piRNA序列
*(raw):每个piRNA在每个样品中的原始read counts
*(norm):每个piRNA在每个样品中的标准化read counts