因为ascp命令是安装在小环境中，而且key_ssh=/home/data/vip13t42/miniconda3/envs/rna/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 这个ascp密钥的变量是即时的，关闭xshell就没了。因此，先写个wx.sh脚本，在脚本中启动小环境，并运行批量下载fastq文件命令。

    1. #!/bin/bash
    3. #先初始化conda
    4. # >>> conda initialize >>>
    5. # !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
    6. __conda_setup="$('/home/data/vip13t42/miniconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
    7. if [ $? -eq 0 ]; then
    8.     eval "$__conda_setup"
    9. else
    10.     if [ -f "/home/data/vip13t42/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
    11.         . "/home/data/vip13t42/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh"
    12.     else
    13.         export PATH="/home/data/vip13t42/miniconda3/bin:$PATH"
    14.     fi
    15. fi
    16. unset __conda_setup
    17. # <<< conda initialize <<<
    19. # 启动小环境，因为ascp命令是安装在小环境中
    20. conda activate rna
    22. # temp.url存放着fastq文件下载地址列表
    23. key_ssh=/home/data/vip13t42/miniconda3/envs/rna/etc/asperaweb_id_dsa.openssh
    24. cat  temp.url | while read id
    25. do
    26. ascp -k 1 -QT -l 300m -P33001 -i $key_ssh era-fasp@${id} ./
    27. done

    然后通过nohup命令来挂载到后台。

    1. nohup wx.sh &

    jobs查看下image.png
    成功挂载到后台运行。

    ——————————————————
    更新：
    生信技能树卖萌哥老师说也可以这样：

    1. key_ssh=/home/data/vip13t42/miniconda3/envs/rna/etc/asperaweb_id_dsa.openssh
    2. cat  temp.url | while read id
    3. do
    4. ascp -k 1 -QT -l 300m -P33001 -i $key_ssh era-fasp@${id} ./
    5. done

    通过Ctrl+z暂停程序，然后运行以下命令也可以挂载到后台，效果等同nohup。

    1. bg %1
    2. disown %1

    亲测有效。