调试你的 Cython 程序

原文: http://docs.cython.org/en/latest/src/userguide/debugging.html

Cython 附带了 GNU Debugger 的扩展,可以帮助用户调试 Cython 代码。要使用此功能,您需要安装 gdb 7.2 或更高版本,使用 Python 支持(链接到 Python 2.6 或更高版本)构建。调试器支持 2.6 及更高版本的调试对象。对于 Python 3,代码应该使用 Python 3 构建,调试器应该使用 Python 2 运行(或者至少它应该能够找到 Python 2 Cython 安装)。请注意,在最新版本的 Ubuntu 中,安装apt-getgdb配置了 Python 3.在这样的系统上,可以通过下载gdb源然后运行来获得gdb的正确配置。 :

  1. ./configure --with-python=python2
  2. make
  3. sudo make install

调试器将需要 Cython 编译器可以导出的调试信息。这可以通过将gdb_debug=True传递给cythonize()在设置脚本中实现:

  1. from distutils.core import setup
  2. from distutils.extension import Extension
  3. extensions = [Extension('source', ['source.pyx'])]
  4. setup(..., ext_modules=cythonize(extensions, gdb_debug=True))

对于开发,将--inplace标志传递给setup.py脚本通常很有帮助,这使得 distutils“就地”构建项目,即不在单独的<cite>构建</cite>目录中。

直接从命令行调用 Cython 时,可以使用--gdb标志写入调试信息:

  1. cython --gdb myfile.pyx

运行调试器

要运行 Cython 调试器并让它导入 Cython 导出的调试信息,请在构建目录中运行cygdb

  1. $ python setup.py build_ext --inplace
  2. $ cygdb
  3. GNU gdb (GDB) 7.2
  4. ...
  5. (gdb)

使用 Cython 调试器时,最好使用使用调试符号编译的解释器构建和运行代码(即使用--with-pydebug配置或使用-g CFLAG 编译)。如果您的包由管理器管理器安装和管理,则可能需要单独安装调试支持。如果使用 NumPy,那么你还需要安装 numpy 调试,否则你会看到多播的导入错误。例如。对于 ubuntu:

  1. $ sudo apt-get install python-dbg python-numpy-dbg
  2. $ python-dbg setup.py build_ext --inplace

然后你还需要用python-dbg运行你的脚本。确保在使用调试符号构建包时,如果先前已编译了 cython 扩展,则重新编译它们。如果您的软件包受版本控制,您可能需要在构建之前执行git clean -fxdhg purge --all

您还可以将其他参数传递给 gdb:

  1. $ cygdb /path/to/build/directory/ GDBARGS

即:

  1. $ cygdb . -- --args python-dbg mainscript.py

要告诉 cygdb 不要导入任何调试信息,请提供--作为第一个参数:

  1. $ cygdb --

使用调试器

Cython 调试器附带了一组支持断点,堆栈检查,源代码列表,步进,单步执行等命令。大多数这些命令与它们各自的 gdb 命令类似。

cy break breakpoints...

打破 Python,Cython 或 C 函数。首先,它将查找具有该名称的 Cython 函数,如果 cygdb 不知道具有该名称的函数(或方法),它将设置(待定)C 断点。 -p选项可用于指定 Python 断点。

可以为函数或方法名设置断点,也可以完全“限定”断点,这意味着给出函数的整个“路径”:

  1. (gdb) cy break cython_function_or_method
  2. (gdb) cy break packagename.cython_module.cython_function
  3. (gdb) cy break packagename.cython_module.ClassName.cython_method
  4. (gdb) cy break c_function

您还可以打破 Cython 行号:

  1. (gdb) cy break :14
  2. (gdb) cy break cython_module:14
  3. (gdb) cy break packagename.cython_module:14

Python 断点当前支持模块的名称(不是整个包路径)和函数或方法:

  1. (gdb) cy break -p python_module.python_function_or_method
  2. (gdb) cy break -p python_function_or_method

注意

Python 断点仅适用于 Python 构建,其中可以从调试器中读取 Python 帧信息。要确保这一点,请使用 Python 调试版本或使用调试支持编译的非剥离版本。

cy step

逐步完成 Python,Cython 或 C 代码。直接从 Cython 代码调用的 Python,Cython 和 C 函数被认为是相关的,并将被引入。

cy next

跨越 Python,Cython 或 C 代码。

cy run

运行程序。默认解释器是用于构建扩展的解释器,或者在“不导入调试信息”选项生效的情况下运行解释器cygdb。可以使用 gdb 的file命令覆盖解释器。

cy cont

继续该计划。

cy up

cy down

在堆栈中上下移动到被认为是相关的框架。

cy finish

执行直到满足向上相关的帧或停止执行。

cy bt

cy backtrace

打印所有相关的框架的回溯。 -a选项使其打印完整的回溯(所有 C 帧)。

cy select

cy backtrace列出的编号选择堆栈帧。引入此命令是因为cy backtrace打印反向堆栈跟踪,因此帧编号与 gdb 的bt不同。

cy print varname

打印本地或全局 Cython,Python 或 C 变量(取决于上下文)。变量也可能被取消引用:

  1. (gdb) cy print x
  2. x = 1
  3. (gdb) cy print *x
  4. *x = (PyObject) {
  5. _ob_next = 0x93efd8,
  6. _ob_prev = 0x93ef88,
  7. ob_refcnt = 65,
  8. ob_type = 0x83a3e0
  9. }

cy set cython_variable = value

将 Cython 堆栈上的 Cython 变量设置为 value。

cy list

列出当前行周围的源代码。

cy locals

cy globals

打印所有本地和全局变量及其值。

cy import FILE...

从作为参数提供的文件中导入调试信息。导入调试信息的最简单方法是使用 cygdb 命令行工具。

cy exec code

在当前的 Python 或 Cython 框架中执行代码。这就像 Python 的交互式解释器一样。

对于 Python 帧,它使用 Python 框架中的全局变量和局部变量,对于 Cython 帧,它使用 Cython 模块上使用的全局变量的 dict 和一个填充了本地 Cython 变量的新 dict。

Note

cy exec修改状态并在调试对象中执行代码,因此可能存在危险。

例:

  1. (gdb) cy exec x + 1
  2. 2
  3. (gdb) cy exec import sys; print sys.version_info
  4. (2, 6, 5, 'final', 0)
  5. (gdb) cy exec
  6. >global foo
  7. >
  8. >foo = 'something'
  9. >end

便利功能

以下函数是 gdb 函数,这意味着它们可以在 gdb 表达式中使用。

cy_cname(varname)

返回 Cython 变量的 C 变量名。对于全局变量,这可能实际上不是有效的。

cy_cvalue(varname)

返回 Cython 变量的值。

cy_eval(expression)

在最近的 Python 或 Cython 框架中评估 Python 代码,并将表达式的结果作为 gdb 值返回。如果成功则提供新引用,出错时为 NULL。

cy_lineno()

返回所选 Cython 帧中的当前行号。

Example:

  1. (gdb) print $cy_cname("x")
  2. $1 = "__pyx_v_x"
  3. (gdb) watch $cy_cvalue("x")
  4. Hardware watchpoint 13: $cy_cvalue("x")
  5. (gdb) cy set my_cython_variable = $cy_eval("{'spam': 'ham'}")
  6. (gdb) print $cy_lineno()
  7. $2 = 12

配置调试器

调试器的一些方面可以使用 gdb 参数进行配置。例如,可以禁用颜色,可以配置终端背景颜色和断点自动完成。

cy_complete_unqualified

告诉 Cython 调试器cy break是否还应该完成普通函数名称,即不以其模块名称为前缀。例如。如果你有一个名为spam的函数,在模块M中,它会告诉你是仅完成M.spam还是只完成spam

默认值为 true。

cy_colorize_code

告诉调试器是否着色源代码。默认值为 true。

cy_terminal_background_color

告诉调试器有关终端背景颜色的信息,这会影响源代码着色。默认值为“dark”,另一个有效选项为“light”。

这是这些参数的使用方式:

  1. (gdb) set cy_complete_unqualified off
  2. (gdb) set cy_terminal_background_color light
  3. (gdb) show cy_colorize_code