与miRNA类似,piRNA可以通过碱基互补配对,靶向mRNA,并调控mRNA表达。我们使用miRanda软件和RNAhybrid软件预测piRNA的靶基因。

    piRNA Gene miRanda RNAhybrid Prediction_score
    mmu_piR_001147 Snx27 1 1 2

    表7. piRNA靶基因预测(miranda)
    各列说明:
    piRNA:piRNA名字
    Gene:基因symbol
    miRanda:miRanda结果。1表示miRanda预测gene是miRNA的靶基因;0表示miRanda预测gene不是miRNA的靶基因
    RNAhybrid:RNAhybrid结果。1表示RNAhybrid预测gene是miRNA的靶基因;0表示RNAhybrid预测gene不是miRNA的靶基因
    Prediction_score:预测得分。1表示1种软件预测到,2表示2种软件都预测到。

    其他文件:RNAhybrid结果,miRanda结果