与miRNA类似,piRNA可以通过碱基互补配对,靶向mRNA,并调控mRNA表达。我们使用miRanda软件和RNAhybrid软件预测piRNA的靶基因。
piRNA | Gene | miRanda | RNAhybrid | Prediction_score |
---|---|---|---|---|
mmu_piR_001147 | Snx27 | 1 | 1 | 2 |
表7. piRNA靶基因预测(miranda)
各列说明:
piRNA:piRNA名字
Gene:基因symbol
miRanda:miRanda结果。1表示miRanda预测gene是miRNA的靶基因;0表示miRanda预测gene不是miRNA的靶基因
RNAhybrid:RNAhybrid结果。1表示RNAhybrid预测gene是miRNA的靶基因;0表示RNAhybrid预测gene不是miRNA的靶基因
Prediction_score:预测得分。1表示1种软件预测到,2表示2种软件都预测到。
其他文件:RNAhybrid结果,miRanda结果