有人突然问EMT score的内容，结果看到了好心网友提供的EMT特征分析网站。下面就来学习下EMTome(http://www.emtome.org/)吧。主要参考[肿瘤EMT特征在线分析网站](https://mp.weixin.qq.com/s/FOa1p870Z08LfrYLg-VVdw)这篇推文。

背景数据集

该数据库主要基于RNA-seq（包括TCGA、CCLE、MET500、HPA）的数据库来进行EMT样本评测，共收录450篇相关文献。并从中找到了810个蛋白编码的和122个非编码的基因。

备注：整个数据库都是基于GSEA的算法来评估肿瘤中EMT特征评分的。

数据库模块

基于以上的数据，作者构建了五个和EMT相关的模块

• EMT Signature: 可以查询之前检索的文献的具体信息，其中包括每一篇文献当中包括哪些基因
• EMT Genes: EMT相关基因在癌症当中的基本特征，包括表达，突变
• EMT Interactome: EMT相关基因在癌症当中的相关功能分析
• EMT Score: 研究某一个基因和某一个EMT特征在不同肿瘤当中的关系，以及在不同肿瘤当中不同EMT评分和预后的关系
• CRISPR/DRUG Response: EMT相关基因和和药物相关性

相当于收集整理了EMT相关基因和文章的数据库，如果对这方面感兴趣，可以深入的探讨下吆。

参考链接

肿瘤EMT特征在线分析网站