R代码手册

白天 夜间 首页 下载 阅读记录
  我的书签   添加书签   移除书签

关于R Project

浏览 204 扫码 分享 2022-07-28 06:03:15

若有收获，就点个赞吧

0 人点赞

上一篇:
下一篇:
  • 书签
  • 添加书签 移除书签
  • 关于R Project
  • 常用函数
    • Apply
    • Lapply
    • 数据框行列求和：rowSums & colSums
    • 数据框合并：merge函数
    • 字符串匹配：grep和grepl函数
    • 数据框排序：dplyr包arrange、group_by函数
    • 字符串截取：stringr包str_sub函数
    • 字符串匹配：stringr包str_detect函数
    • 字符串拆分：stringr包str_split函数
    • 一列分为多列：tidyr包separate函数
    • 宽数据转长数据：tidyr包pivot_longer函数
  • 数据处理
    • 计算均值和SE，生成data farme用于画图
    • 计算各组均值、SD和SE
    • 生成DNA反向互补序列
    • 替换离群值
  • 常规统计
    • T-test
    • One Way ANOVA
    • Two Way ANOVA
    • Orthogonal contrast analysis (统计 作图 拼图)
    • 非线形拟合
    • 分段回归(break point 回归)
    • GLMM
    • 批量T test
    • 批量One way Anova
  • RNA-Seq
    • 功能注释柱状图
    • DEG & Normalization
    • 火山图
    • Venn图
    • PCA
    • Correlation Analyses
    • Heatmap
    • KEGG Enrichment
    • GO Enrichment
    • GSEA
    • 无参OVA和GSEA分析
    • 使用自己的基因集进行富集分析
    • Enrich map plot：emapplot{enrichplot}
    • GO有向无环图：goplot {enrichplot}
    • goplot {enrichplot}可视化"gseaResult"时的问题及解决方案
    • 获取非模式生物的OrgDb包
    • qPCR验证图
    • 公共数据挖掘：标准化，寻找目标基因做方差分析
    • 公共数据挖掘：GEO数据ID转换
    • 单细胞转录组
  • 蛋白组学
    • 使用T-test进行蛋白组差异蛋白分析
    • 使用Limma进行蛋白组差异蛋白分析
    • 获取KEGG特定通路的所有基因用于富集分析
  • 代谢组学
    • 数据清洗及差异代谢物鉴定（VIP>1 & p<0.05）
  • 16S
    • 菌群Co-occurrence网络图
  • 画图
    • 单系列柱状图
    • 多系列柱状图
    • 多系列折线图
    • 相关性散点图
    • 画一圈圆形的散点
    • 代谢组KEGG pathway富集分析气泡图
    • 代谢富集分析（MSEA）图
    • 韦恩图(Venn)
    • pheatmap热图添加指定基因标签
    • ggplot2导出ppt
  • 其他
    • 文献计量学：bibliometrix包
    • 形态性状对质量性状的影响
暂无相关搜索结果！

    让时间为你证明

    展开/收起文章目录

    分享，让知识传承更久远

    文章二维码

    手机扫一扫，轻松掌上读

    文档下载

    请下载您需要的格式的文档，随时随地，享受汲取知识的乐趣！
    PDF文档 EPUB文档 MOBI文档

    书签列表

      阅读记录

      阅读进度: 0.00% ( 0/0 ) 重置阅读进度
        思维导图备注